Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 PHO86YJL117W 936 nt6.05□□□□□ -1.44
BRF1P29056 LDS1YAL018C 978 nt6.05□□□□□ -1.44
BRF1P29056 ECM19YLR390W 339 nt6.05□□□□□ -1.44
BRF1P29056 SWP1YMR149W 861 nt6.05□□□□□ -1.44
BRF1P29056 RRS1YOR294W 612 nt6.05□□□□□ -1.44
BRF1P29056 RPL21AYBR191W 483 nt6.05□□□□□ -1.44
BRF1P29056 YHL017WYHL017W 1599 nt6.05□□□□□ -1.44
BRF1P29056 MTF2YDL044C 1323 nt6.04□□□□□ -1.44
BRF1P29056 PET112YBL080C 1626 nt6.04□□□□□ -1.44
BRF1P29056 TMT1YER175C 900 nt6.04□□□□□ -1.44
BRF1P29056 YKL223WYKL223W 333 nt6.04□□□□□ -1.44
BRF1P29056 NPT1YOR209C 1290 nt6.04□□□□□ -1.44
BRF1P29056 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.04□□□□□ -1.44
BRF1P29056 RAD53YPL153C 2466 nt6.04□□□□□ -1.44
BRF1P29056 PGK1YCR012W 1251 nt6.03□□□□□ -1.44
BRF1P29056 RPS16BYDL083C 432 nt6.03□□□□□ -1.44
BRF1P29056 DON1YDR273W 1098 nt6.03□□□□□ -1.44
BRF1P29056 IPK1YDR315C 846 nt6.03□□□□□ -1.44
BRF1P29056 YJL193WYJL193W 1209 nt6.03□□□□□ -1.44
BRF1P29056 snR32snR32 188 nt6.03□□□□□ -1.44
BRF1P29056 KEX2YNL238W 2445 nt6.03□□□□□ -1.44
BRF1P29056 GIT1YCR098C 1557 nt6.02□□□□□ -1.45
BRF1P29056 GAS3YMR215W 1575 nt6.02□□□□□ -1.45
BRF1P29056 CKA2YOR061W 1020 nt6.02□□□□□ -1.45
BRF1P29056 URA7YBL039C 1740 nt6.02□□□□□ -1.45
BRF1P29056 GSY2YLR258W 2118 nt6.01□□□□□ -1.45
BRF1P29056 SRG1SRG1 551 nt6.01□□□□□ -1.45
BRF1P29056 ADK2YER170W 678 nt6.01□□□□□ -1.45
BRF1P29056 NRM1YNR009W 750 nt6.01□□□□□ -1.45
BRF1P29056 PZF1YPR186C 1290 nt6.01□□□□□ -1.45
BRF1P29056 DBF2YGR092W 1719 nt6.01□□□□□ -1.45
BRF1P29056 PIF1YML061C 2580 nt6.01□□□□□ -1.45
BRF1P29056 PMA1YGL008C 2757 nt6.01□□□□□ -1.45
BRF1P29056 VPS4YPR173C 1314 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YCK1YHR135C 1617 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 SNF11YDR073W 510 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YHR145CYHR145C 357 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 EPS1YIL005W 2106 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 SHP1YBL058W 1272 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 MRPS16YPL013C 366 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YPL102CYPL102C 303 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 RRN3YKL125W 1884 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 DPB2YPR175W 2070 nt6□□□□□ -1.45
BRF1P29056 MDM31YHR194W 1740 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 BUD14YAR014C 2130 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 RGT1YKL038W 3513 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 MNS1YJR131W 1650 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YDL129WYDL129W 876 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 PHM8YER037W 966 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YML083CYML083C 1257 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YOL163WYOL163W 510 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 PWP1YLR196W 1731 nt5.99□□□□□ -1.45
BRF1P29056 ACS2YLR153C 2052 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 ARN2YHL047C 1863 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 WHI2YOR043W 1461 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YTP1YNL237W 1380 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YGL235WYGL235W 537 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YIR042CYIR042C 711 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 MTC2YKL098W 1074 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YLR126CYLR126C 756 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 TSA1YML028W 591 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 NGL2YMR285C 1548 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 GUS1YGL245W 2127 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 ADE12YNL220W 1302 nt5.98□□□□□ -1.45
BRF1P29056 KCH1YJR054W 1494 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 CNM67YNL225C 1746 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YEL068CYEL068C 333 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 EFM3YJR129C 1020 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 ELA1YNL230C 1140 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 IFA38YBR159W 1044 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 MNN5YJL186W 1761 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 YNL095CYNL095C 1929 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 ARB1YER036C 1833 nt5.97□□□□□ -1.45
BRF1P29056 RIM101YHL027W 1878 nt5.96□□□□□ -1.45
BRF1P29056 ATG23YLR431C 1362 nt5.96□□□□□ -1.45
BRF1P29056 APE1YKL103C 1545 nt5.96□□□□□ -1.46
BRF1P29056 PRS2YER099C 957 nt5.96□□□□□ -1.46
BRF1P29056 RPT6YGL048C 1218 nt5.96□□□□□ -1.46
BRF1P29056 RPL7AYGL076C 735 nt5.96□□□□□ -1.46
BRF1P29056 CIN4YMR138W 576 nt5.96□□□□□ -1.46
BRF1P29056 CAM1YPL048W 1248 nt5.96□□□□□ -1.46
BRF1P29056 RPL7BYPL198W 735 nt5.96□□□□□ -1.46
BRF1P29056 ERC1YHR032W 1746 nt5.95□□□□□ -1.46
BRF1P29056 REV7YIL139C 738 nt5.95□□□□□ -1.46
BRF1P29056 ASK1YKL052C 879 nt5.95□□□□□ -1.46
BRF1P29056 RRT2YBR246W 1164 nt5.95□□□□□ -1.46
BRF1P29056 MNN2YBR015C 1794 nt5.95□□□□□ -1.46
BRF1P29056 TEP1YNL128W 1305 nt5.95□□□□□ -1.46
BRF1P29056 ATG18YFR021W 1503 nt5.94□□□□□ -1.46
BRF1P29056 CNE1YAL058W 1509 nt5.94□□□□□ -1.46
BRF1P29056 TRP1YDR007W 675 nt5.94□□□□□ -1.46
BRF1P29056 DFM1YDR411C 1026 nt5.94□□□□□ -1.46
BRF1P29056 YGR139WYGR139W 339 nt5.94□□□□□ -1.46
BRF1P29056 SLD7YOR060C 774 nt5.94□□□□□ -1.46
BRF1P29056 GLN1YPR035W 1113 nt5.94□□□□□ -1.46
BRF1P29056 YPR114WYPR114W 948 nt5.94□□□□□ -1.46
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