Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GINS3Q9BRX5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GINS3Q9BRX5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GINS3Q9BRX5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms