Protein–RNA interactions for Protein: Q99217

AMELX, Amelogenin, X isoform, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMELXQ99217 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMELXQ99217 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMELXQ99217 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms