Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 ARG81YML099C 2643 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 EMP46YLR080W 1335 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 RPB4YJL140W 666 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 PRE7YBL041W 726 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 SUA5YGL169W 1281 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 YJR012CYJR012C 624 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1B-ORQ92393 PPR1YLR014C 2715 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 SEC23YPR181C 2307 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 GCD11YER025W 1584 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YPR204WYPR204W 3099 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 IPK1YDR315C 846 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 BGL2YGR282C 942 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 RPN6YDL097C 1305 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 RPS2YGL123W 765 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 RPL3YOR063W 1164 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 MOD5YOR274W 1287 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 DUS4YLR405W 1104 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 FEX1YOR390W 1128 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 FEX2YPL279C 1128 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 RPT1YKL145W 1404 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YHL017WYHL017W 1599 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YHR045WYHR045W 1683 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 MLF3YNL074C 1359 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YNR048WYNR048W 1182 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 NUP116YMR047C 3342 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 VNX1YNL321W 2727 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 YJL068CYJL068C 900 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 EFM3YJR129C 1020 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 ICE2YIL090W 1476 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 TRK2YKR050W 2670 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 TEF1YPR080W 1377 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 TEF2YBR118W 1377 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 VPS70YJR126C 2436 nt8.46□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 NOP8YOL144W 1455 nt8.46□□□□□ -1.05
TY1B-ORQ92393 GAT1YFL021W 1533 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 YPK2YMR104C 2034 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 IES1YFL013C 2079 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 ERC1YHR032W 1746 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 MNN5YJL186W 1761 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 ALT1YLR089C 1779 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 HAP2YGL237C 798 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 CAM1YPL048W 1248 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 POM33YLL023C 840 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 STM1YLR150W 822 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 RAD3YER171W 2337 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 YJL171CYJL171C 1191 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 YOL163WYOL163W 510 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 ECM38YLR299W 1983 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 SUP2tY(GUA)D 75 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 SUP11tY(GUA)F1 75 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 SUP6tY(GUA)F2 75 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 SUP7tY(GUA)J1 75 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 SUP4tY(GUA)J2 75 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 SUP5tY(GUA)M1 75 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 SUP8tY(GUA)M2 75 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 SUP3tY(GUA)O 75 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 IFA38YBR159W 1044 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 UGO1YDR470C 1509 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 YDR134CYDR134C 411 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 PRP45YAL032C 1140 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 FET3YMR058W 1911 nt8.4□□□□□ -1.06
TY1B-ORQ92393 TUB2YFL037W 1374 nt8.39□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 YMR111CYMR111C 1389 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 TOS4YLR183C 1470 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 BUL1YMR275C 2931 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 RME1YGR044C 903 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 CAB4YGR277C 918 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 RPP0YLR340W 939 nt8.38□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 MSH1YHR120W 2880 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 YPS7YDR349C 1791 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 YNL190WYNL190W 615 nt8.37□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 RRN10YBL025W 438 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 ROX3YBL093C 663 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 SKN1YGR143W 2316 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 PGK1YCR012W 1251 nt8.35□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 DED81YHR019C 1665 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 KSS1YGR040W 1107 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 RBD2YPL246C 789 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 TOM5YPR133W-A 153 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 HSP78YDR258C 2436 nt8.34□□□□□ -1.07
TY1B-ORQ92393 TAX4YJL083W 1815 nt8.34□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 YER148W-AYER148W-A 579 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 COQ6YGR255C 1440 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 RQC1YDR333C 2172 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 YPR195CYPR195C 330 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 YAP1YML007W 1953 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 SCT1YBL011W 2280 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 SPC34YKR037C 888 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 MNN10YDR245W 1182 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 YIL060WYIL060W 435 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 CIR2YOR356W 1896 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 GAL2YLR081W 1725 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 GGC1YDL198C 903 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 LYS5YGL154C 819 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1B-ORQ92393 OAZ1YPL052W 879 nt8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.6 ms