Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKAP2Q8WWK9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP2Q8WWK9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2Q8WWK9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms