Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNI2Q6ZMN8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms