Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL28P46779 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL28P46779 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL28P46779 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL28P46779 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL28P46779 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL28P46779 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL28P46779 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL28P46779 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL28P46779 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL28P46779 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL28P46779 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL28P46779 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL28P46779 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL28P46779 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL28P46779 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL28P46779 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL28P46779 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL28P46779 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL28P46779 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms