Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	ERG7	YHR072W	2196 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	MIF2	YKL089W	1650 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	PDA1	YER178W	1263 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YLR312C	YLR312C	1197 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YLR402W	YLR402W	192 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	MRPL4	YLR439W	960 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	HTZ1	YOL012C	405 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	TSR3	YOR006C	942 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	GPB2	YAL056W	2643 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	KEX2	YNL238W	2445 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	AAP1	YHR047C	2571 nt		5.48	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	CCZ1	YBR131W	2115 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YDR541C	YDR541C	1035 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	PRI1	YIR008C	1230 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	MPM1	YJL066C	759 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	OMA1	YKR087C	1038 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	PSR1	YLL010C	1284 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	PTH2	YBL057C	627 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YIR007W	YIR007W	2295 nt		5.47	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YOL036W	YOL036W	2286 nt		5.46	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	MFG1	YDL233W	1377 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	RPL7A	YGL076C	735 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	SPO74	YGL170C	1242 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	SPG1	YGR236C	288 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	ARP1	YHR129C	1155 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YKR073C	YKR073C	321 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	TIF34	YMR146C	1044 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	OSW5	YMR148W	447 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	SEC17	YBL050W	879 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YPQ1	YOL092W	927 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	TMA46	YOR091W	1038 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YPL067C	YPL067C	597 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	MRP51	YPL118W	1035 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	RPL7B	YPL198W	735 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	SFB3	YHR098C	2790 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	COQ1	YBR003W	1422 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YHL017W	YHL017W	1599 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	SRV2	YNL138W	1581 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	RBA50	YDR527W	1320 nt		5.46	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	TNA1	YGR260W	1605 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	NTE1	YML059C	5040 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	ICP55	YER078C	1536 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	CYS4	YGR155W	1524 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YDL241W	YDL241W	372 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	RMD5	YDR255C	1266 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	TRR2	YHR106W	1029 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	EFM3	YJR129C	1020 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	OGG1	YML060W	1131 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YML079W	YML079W	606 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	DOM34	YNL001W	1161 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	CPA1	YOR303W	1236 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YPR123C	YPR123C	435 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	PGM1	YKL127W	1713 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	CRZ1	YNL027W	2037 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	NFI1	YOR156C	2181 nt		5.45	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	HST4	YDR191W	1113 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YDR396W	YDR396W	501 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	DOT1	YDR440W	1749 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	VPS4	YPR173C	1314 nt		5.44	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	FET3	YMR058W	1911 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	MKC7	YDR144C	1791 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	CTR2	YHR175W	570 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YJR146W	YJR146W	354 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YLL056C	YLL056C	897 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YML083C	YML083C	1257 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	MRPL19	YNL185C	477 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	RAD17	YOR368W	1206 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	PYC2	YBR218C	3543 nt		5.43	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	MSC3	YLR219W	2187 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	PYC1	YGL062W	3537 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	PHM8	YER037W	966 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	IRC7	YFR055W	1023 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YGR011W	YGR011W	327 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	MRS1	YIR021W	1092 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	XPT1	YJR133W	630 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	APN1	YKL114C	1104 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	NMD4	YLR363C	657 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YBL029W	YBL029W	1131 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	BSC4	YNL269W	396 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YOL024W	YOL024W	519 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	RFC4	YOL094C	972 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	RKI1	YOR095C	777 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	snR30	snR30	606 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YCL049C	YCL049C	939 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	APE4	YHR113W	1473 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	URA7	YBL039C	1740 nt		5.42	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	VRP1	YLR337C	2454 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YHR095W	YHR095W	495 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YJL215C	YJL215C	360 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	AIM24	YJR080C	1185 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	GEP5	YLR091W	882 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YPL102C	YPL102C	303 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	YPR109W	YPR109W	885 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	UGO1	YDR470C	1509 nt		5.41	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	PPR1	YLR014C	2715 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	PDR18	YNR070W	4002 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	DBP9	YLR276C	1785 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	CWC21	YDR482C	408 nt		5.4	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.9 ms