Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EBF4Q9BQW3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms