Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR48Q8TAF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR48Q8TAF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR48Q8TAF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR48Q8TAF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR48Q8TAF3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms