Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX2Q3B8N5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PROX2Q3B8N5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX2Q3B8N5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms