Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 ORM1YGR038W 669 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 ICS3YJL077C 396 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 MRPS5YBR251W 924 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 AFG1YEL052W 1530 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 PXL1YKR090W 2121 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 SPS22YCL048W 1392 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 ATF1YOR377W 1578 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 RSP5YER125W 2430 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 GPB2YAL056W 2643 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 FZF1YGL254W 900 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 YHR145CYHR145C 357 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 YML083CYML083C 1257 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 MRPS12YNR036C 462 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 UBC11YOR339C 471 nt6.06□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 GYP8YFL027C 1494 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 PKC1YBL105C 3456 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 IRC7YFR055W 1023 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 ATG12YBR217W 561 nt6.05□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 FRS2YFL022C 1512 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 JIP4YDR475C 2631 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 CLN1YMR199W 1641 nt6.04□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF2Q12221 MPA43YNL249C 1629 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 MRPL1YDR116C 858 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 EGD2YHR193C 525 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 BMT5YIL096C 1011 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 ASK1YKL052C 879 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 OST3YOR085W 1053 nt6.04□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 GLN1YPR035W 1113 nt6.04□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF2Q12221 SLX5YDL013W 1860 nt6.04□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF2Q12221 NMT1YLR195C 1368 nt6.03□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 CMR1YDL156W 1569 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 PFK2YMR205C 2880 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 YFL052WYFL052W 1398 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 NOG2YNR053C 1461 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 GAA1YLR088W 1845 nt6.02□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 YBR284WYBR284W 2394 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 MRK1YDL079C 1506 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 GPI11YDR302W 660 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 AAD15YOL165C 432 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 TFC6YDR362C 2019 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 YHL017WYHL017W 1599 nt6.01□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 MKK1YOR231W 1527 nt6□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 YFR006WYFR006W 1608 nt6□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 APE3YBR286W 1614 nt6□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 SYF2YGR129W 648 nt6□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 EFM3YJR129C 1020 nt6□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 OPT1YJL212C 2400 nt6□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 HXT2YMR011W 1626 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 YDR109CYDR109C 2148 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 GIT1YCR098C 1557 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 PGK1YCR012W 1251 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 CNE1YAL058W 1509 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 UTP6YDR449C 1323 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 GLN3YER040W 2193 nt5.99□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 DJP1YIR004W 1299 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 HST2YPL015C 1074 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 YBR144CYBR144C 315 nt5.98□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 ATG23YLR431C 1362 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 RPN11YFR004W 921 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 CSL4YNL232W 879 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 YOL036WYOL036W 2286 nt5.97□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 PUF3YLL013C 2640 nt5.96□□□□□ -1.45
PUF2Q12221 REV7YIL139C 738 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YOL163WYOL163W 510 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 MTF2YDL044C 1323 nt5.96□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 HOS2YGL194C 1359 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 RRP4YHR069C 1080 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SNO4YMR322C 714 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 AST1YBL069W 1290 nt5.95□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBL070CYBL070C 321 nt5.95□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 YNL200CYNL200C 741 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 HSP33YOR391C 714 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 RPS9AYPL081W 594 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 HSP32YPL280W 714 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 CYC8YBR112C 2901 nt5.95□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 MNN5YJL186W 1761 nt5.95□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 PRP24YMR268C 1335 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YDL172CYDL172C 480 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 FPR2YDR519W 408 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YUR1YJL139C 1287 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YJU3YKL094W 942 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SSP120YLR250W 705 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YNR040WYNR040W 771 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SLD7YOR060C 774 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 RAD3YER171W 2337 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 HXT15YDL245C 1704 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 HXT16YJR158W 1704 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YDL114WYDL114W 927 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SEC20YDR498C 1152 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 ERP5YHR110W 639 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.93□□□□□ -1.46
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