Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 FOB1YDR110W 1701 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 NTH2YBR001C 2343 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YDR396WYDR396W 501 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 AIM24YJR080C 1185 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 POR1YNL055C 852 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 SLD7YOR060C 774 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YHK8YHR048W 1545 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 NOP2YNL061W 1857 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 CCZ1YBR131W 2115 nt6.02□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 RPL7AYGL076C 735 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YRB2YIL063C 984 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 MPM1YJL066C 759 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 RNH1YMR234W 1047 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 RKI1YOR095C 777 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 MCP1YOR228C 909 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 RPL7BYPL198W 735 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 ATG23YLR431C 1362 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 COX15YER141W 1461 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 EXO1YOR033C 2109 nt6.01□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 FAL1YDR021W 1200 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 VAM7YGL212W 951 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YAR064WYAR064W 300 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 LDB7YBL006C 543 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YNL019CYNL019C 855 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YNL033WYNL033W 855 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 NRM1YNR009W 750 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 COQ3YOL096C 939 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YME1YPR024W 2244 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 ISN1YOR155C 1353 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 EEB1YPL095C 1371 nt6□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 PEX3YDR329C 1326 nt5.99□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 CRH1YGR189C 1524 nt5.99□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 CDC34YDR054C 888 nt5.99□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 SCO2YBR024W 906 nt5.99□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 SPE3YPR069C 882 nt5.99□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 PET112YBL080C 1626 nt5.99□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YGR054WYGR054W 1929 nt5.98□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 TRP1YDR007W 675 nt5.98□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 ARP1YHR129C 1155 nt5.98□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 AVO2YMR068W 1281 nt5.98□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 ENV9YOR246C 993 nt5.98□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 CLB1YGR108W 1416 nt5.98□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 BIO3YNR058W 1443 nt5.98□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 UBX2YML013W 1755 nt5.98□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YHL017WYHL017W 1599 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 VPS61YDR136C 573 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 GUS1YGL245W 2127 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 YHR145CYHR145C 357 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 LYS1YIR034C 1122 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 MDE1YJR024C 735 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 SEC17YBL050W 879 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 PDR16YNL231C 1056 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 LSC1YOR142W 990 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 PEX32YBR168W 1242 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 LDB16YCL005W 771 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 ELP2YGR200C 2367 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 RBA50YDR527W 1320 nt5.97□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 PGM1YKL127W 1713 nt5.96□□□□□ -1.45
NFI1Q12216 RPR2YIR015W 435 nt5.96□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 HOC1YJR075W 1191 nt5.96□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 RUF23RUF23 254 nt5.96□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 RDL1YOR285W 420 nt5.96□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 MPH3YJR160C 1809 nt5.96□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 PMT2YAL023C 2280 nt5.96□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 VPS4YPR173C 1314 nt5.96□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 VAN1YML115C 1608 nt5.96□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 SOG2YOR353C 2376 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 MRPL1YDR116C 858 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 VMA3YEL027W 483 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 OCA5YHL029C 2040 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 DMA1YHR115C 1251 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 REV7YIL139C 738 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 QCR8YJL166W 285 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 YNL108CYNL108C 813 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 ERI1YPL096C-A 207 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 ECM33YBR078W 1290 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 ARE2YNR019W 1929 nt5.95□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 DBP8YHR169W 1296 nt5.94□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 LIA1YJR070C 978 nt5.94□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 BSC4YNL269W 396 nt5.94□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 YBR027CYBR027C 333 nt5.94□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.93□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 ASF1YJL115W 840 nt5.93□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 CTF19YPL018W 1110 nt5.93□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 ECM2YBR065C 1095 nt5.93□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 FET3YMR058W 1911 nt5.93□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 CCT8YJL008C 1707 nt5.93□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 CNM67YNL225C 1746 nt5.93□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 COA1YIL157C 594 nt5.92□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 IES2YNL215W 963 nt5.92□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 MDY2YOL111C 639 nt5.92□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 MET7YOR241W 1647 nt5.92□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 HRQ1YDR291W 3234 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 IMA1YGR287C 1770 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 NGL2YMR285C 1548 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 LCL3YGL085W 825 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 BNS1YGR230W 414 nt5.91□□□□□ -1.46
NFI1Q12216 FMO1YHR176W 1299 nt5.91□□□□□ -1.46
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