Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 IDP1YDL066W 1287 nt5.73□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 YEL068CYEL068C 333 nt5.73□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 POR1YNL055C 852 nt5.73□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 YPK2YMR104C 2034 nt5.73□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 YEH1YLL012W 1722 nt5.73□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 UIP5YKR044W 1332 nt5.73□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 QNS1YHR074W 2145 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 TFC6YDR362C 2019 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 LSG1YGL099W 1923 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 ASN1YPR145W 1719 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 VPS70YJR126C 2436 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 RME1YGR044C 903 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 PUS4YNL292W 1212 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 YMR279CYMR279C 1623 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 SUB2YDL084W 1341 nt5.72□□□□□ -1.49
YMR226CQ05016 SDH4YDR178W 546 nt5.71□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YER186CYER186C 921 nt5.71□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 RPS2YGL123W 765 nt5.71□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 ECM14YHR132C 1293 nt5.71□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 SCS7YMR272C 1155 nt5.71□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YBR027CYBR027C 333 nt5.71□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YPR114WYPR114W 948 nt5.71□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 LDB19YOR322C 2457 nt5.71□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 TRP5YGL026C 2124 nt5.7□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 LDS1YAL018C 978 nt5.7□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 URA1YKL216W 945 nt5.7□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YKL223WYKL223W 333 nt5.7□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 AAT2YLR027C 1257 nt5.7□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 MRPS16YPL013C 366 nt5.7□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 ERC1YHR032W 1746 nt5.7□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 MCM3YEL032W 2916 nt5.7□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 HSP104YLL026W 2727 nt5.69□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 GSY2YLR258W 2118 nt5.69□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.69□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YEL020CYEL020C 1683 nt5.69□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 EMW1YNL313C 2715 nt5.68□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 CDC34YDR054C 888 nt5.68□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.68□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 RIM101YHL027W 1878 nt5.68□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 RSC2YLR357W 2670 nt5.68□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 ATG4YNL223W 1485 nt5.67□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 CWC21YDR482C 408 nt5.67□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 SIP2YGL208W 1248 nt5.67□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.67□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YLR317WYLR317W 435 nt5.67□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YNL108CYNL108C 813 nt5.67□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 HST2YPL015C 1074 nt5.67□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 ILV6YCL009C 930 nt5.67□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 DIA3YDL024C 1407 nt5.66□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 CRF1YDR223W 1404 nt5.66□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 MDM31YHR194W 1740 nt5.66□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 CUP2YGL166W 678 nt5.66□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YIL077CYIL077C 963 nt5.66□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YPL041CYPL041C 624 nt5.66□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 ENT2YLR206W 1842 nt5.66□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 MID1YNL291C 1647 nt5.66□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YPL277CYPL277C 1464 nt5.65□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 YGL072CYGL072C 360 nt5.65□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 COS10YNR075W 1125 nt5.65□□□□□ -1.5
YMR226CQ05016 QDR3YBR043C 2070 nt5.65□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 ASH1YKL185W 1767 nt5.65□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 RVB2YPL235W 1416 nt5.65□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 NHA1YLR138W 2958 nt5.64□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SKN1YGR143W 2316 nt5.64□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 VCX1YDL128W 1236 nt5.64□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 MED6YHR058C 888 nt5.64□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 STM1YLR150W 822 nt5.64□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 TKL1YPR074C 2043 nt5.64□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 GPB2YAL056W 2643 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 KSS1YGR040W 1107 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 MPC2YHR162W 390 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 ASK1YKL052C 879 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 CWC27YPL064C 906 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 RPO26YPR187W 468 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 OPT1YJL212C 2400 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 HSF1YGL073W 2502 nt5.63□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SSK1YLR006C 2139 nt5.62□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 YDR187CYDR187C 519 nt5.62□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 HAP3YBL021C 435 nt5.62□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 YMR027WYMR027W 1413 nt5.62□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 YPR196WYPR196W 1413 nt5.62□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SSK22YCR073C 3996 nt5.61□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 YET3YDL072C 612 nt5.61□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SET5YHR207C 1581 nt5.61□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 RHO2YNL090W 579 nt5.61□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 RET1YOR207C 3450 nt5.61□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 ELP3YPL086C 1674 nt5.61□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 TAE1YBR261C 699 nt5.61□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 GIT1YCR098C 1557 nt5.6□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.6□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.6□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.6□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 VPS24YKL041W 675 nt5.6□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 VMS1YDR049W 1899 nt5.6□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SRP101YDR292C 1866 nt5.6□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 PKC1YBL105C 3456 nt5.6□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 SMF2YHR050W 1650 nt5.59□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 CLP1YOR250C 1338 nt5.59□□□□□ -1.51
YMR226CQ05016 MAK31YCR020C-A 267 nt5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.7 ms