Protein–RNA interactions for Protein: P00445

SOD1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], yeast

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	P00445	SUP11	tY(GUA)F1	75 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	SUP6	tY(GUA)F2	75 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	SUP7	tY(GUA)J1	75 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	SUP4	tY(GUA)J2	75 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	SUP5	tY(GUA)M1	75 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	SUP8	tY(GUA)M2	75 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	SUP3	tY(GUA)O	75 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	YML018C	YML018C	1182 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	MRPL10	YNL284C	969 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	CAF40	YNL288W	1122 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	MCM3	YEL032W	2916 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SOD1	P00445	EPS1	YIL005W	2106 nt		4.84	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	SKN1	YGR143W	2316 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	NMT1	YLR195C	1368 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YEL075W-A	YEL075W-A	612 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	PHB1	YGR132C	864 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	MGM101	YJR144W	810 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	SRY1	YKL218C	981 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	TAL1	YLR354C	1008 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YLR463C	YLR463C	552 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	JNM1	YMR294W	1122 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YNL285W	YNL285W	372 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YPL136W	YPL136W	369 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	HSP104	YLL026W	2727 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	ATG4	YNL223W	1485 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YDL218W	YDL218W	954 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	HAP3	YBL021C	435 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	SCO2	YBR024W	906 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	PKC1	YBL105C	3456 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	BUR6	YER159C	429 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	HGH1	YGR187C	1185 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YKL223W	YKL223W	333 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	IDP3	YNL009W	1263 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	FSF1	YOR271C	984 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	CBK1	YNL161W	2271 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	GSY2	YLR258W	2118 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	UTP4	YDR324C	2331 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	TBF1	YPL128C	1689 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	HAL5	YJL165C	2568 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	AIM3	YBR108W	2844 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YNR040W	YNR040W	771 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	HMT1	YBR034C	1047 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	PYC1	YGL062W	3537 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	GPB2	YAL056W	2643 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	SSK22	YCR073C	3996 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	RAD3	YER171W	2337 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	TRP3	YKL211C	1455 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	UBP13	YBL067C	2244 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	RAD24	YER173W	1980 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	DOT5	YIL010W	648 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YJU3	YKL094W	942 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	POR1	YNL055C	852 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	RNH201	YNL072W	924 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	XBP1	YIL101C	1944 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	ATP1	YBL099W	1638 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	RIM101	YHL027W	1878 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	CWC21	YDR482C	408 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	RPS5	YJR123W	678 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	QRI5	YLR204W	336 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YNL042W-B	YNL042W-B	258 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SOD1	P00445	YEL020C	YEL020C	1683 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	HSP78	YDR258C	2436 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	GIT1	YCR098C	1557 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YIL077C	YIL077C	963 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YEH1	YLL012W	1722 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	PFA3	YNL326C	1011 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	RPN7	YPR108W	1290 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	HAP2	YGL237C	798 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	RME1	YGR044C	903 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	SRN2	YLR119W	642 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	CIN4	YMR138W	576 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	ERC1	YHR032W	1746 nt		4.75	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	DJP1	YIR004W	1299 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YLR184W	YLR184W	348 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	EEB1	YPL095C	1371 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YIR007W	YIR007W	2295 nt		4.74	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	RET1	YOR207C	3450 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YDL057W	YDL057W	987 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YDL129W	YDL129W	876 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	COX20	YDR231C	618 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YER148W-A	YER148W-A	579 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	SUP19	tS(UGA)E	82 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	SUP17	tS(UGA)I	82 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	SUP16	tS(UGA)P	82 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YJL211C	YJL211C	444 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	GCV3	YAL044C	513 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	IMD1	YAR073W	1212 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YNL097W-A	YNL097W-A	156 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	YPK2	YMR104C	2034 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	DBP9	YLR276C	1785 nt		4.73	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	DIA3	YDL024C	1407 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	MKK1	YOR231W	1527 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	VTH1	YIL173W	4650 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	VTH2	YJL222W	4650 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	APE3	YBR286W	1614 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	STE13	YOR219C	2796 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	ENT2	YLR206W	1842 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	IDP1	YDL066W	1287 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	VCX1	YDL128W	1236 nt		4.72	□□□□□ -1.65
SOD1	P00445	GAL83	YER027C	1254 nt		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 127 ms