Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms