Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 SPO7YAL009W 780 nt5.99□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 YHM2YMR241W 945 nt5.99□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 PRP2YNR011C 2631 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 ISN1YOR155C 1353 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 YDR278CYDR278C 318 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 DAP1YPL170W 459 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 TPO3YPR156C 1869 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 PXL1YKR090W 2121 nt5.98□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 COR1YBL045C 1374 nt5.97□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 HAL5YJL165C 2568 nt5.97□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 SYF2YGR129W 648 nt5.97□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.97□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.97□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 RGT2YDL138W 2292 nt5.97□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 NMD5YJR132W 3147 nt5.96□□□□□ -1.45
PEX11Q12462 KKQ8YKL168C 2175 nt5.96□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.96□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 DUS4YLR405W 1104 nt5.96□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 GPA1YHR005C 1419 nt5.96□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 ATG4YNL223W 1485 nt5.96□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 AFG1YEL052W 1530 nt5.95□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 YDL172CYDL172C 480 nt5.95□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 PHB1YGR132C 864 nt5.95□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 MOD5YOR274W 1287 nt5.95□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 ATG12YBR217W 561 nt5.95□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 GPB2YAL056W 2643 nt5.95□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 RPT3YDR394W 1287 nt5.94□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 ERP5YHR110W 639 nt5.94□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 MRPS12YNR036C 462 nt5.94□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 PDR18YNR070W 4002 nt5.93□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 AAD15YOL165C 432 nt5.93□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 UBC11YOR339C 471 nt5.93□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 GYP8YFL027C 1494 nt5.93□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 MTF2YDL044C 1323 nt5.93□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 AGP2YBR132C 1791 nt5.93□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 MRPL1YDR116C 858 nt5.92□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 CSL4YNL232W 879 nt5.92□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 MRK1YDL079C 1506 nt5.92□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 TEP1YNL128W 1305 nt5.92□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 YNL200CYNL200C 741 nt5.91□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 PET112YBL080C 1626 nt5.91□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 HSM3YBR272C 1443 nt5.91□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 GLN1YPR035W 1113 nt5.9□□□□□ -1.46
PEX11Q12462 ACO1YLR304C 2337 nt5.9□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 SNO4YMR322C 714 nt5.89□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 HSP33YOR391C 714 nt5.89□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 HSP32YPL280W 714 nt5.89□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 PUF3YLL013C 2640 nt5.89□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 FRS2YFL022C 1512 nt5.89□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 VTS1YOR359W 1572 nt5.89□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 TOS2YGR221C 1869 nt5.88□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.88□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.88□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.88□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 MCM3YEL032W 2916 nt5.88□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 ICS3YJL077C 396 nt5.87□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 YBR144CYBR144C 315 nt5.87□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 PHO3YBR092C 1404 nt5.87□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 HGH1YGR187C 1185 nt5.86□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 DON1YDR273W 1098 nt5.85□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 RPN11YFR004W 921 nt5.85□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 MTC2YKL098W 1074 nt5.85□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 CCP1YKR066C 1086 nt5.85□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 IFA38YBR159W 1044 nt5.85□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 ERG12YMR208W 1332 nt5.84□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 PGK1YCR012W 1251 nt5.84□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 YOR300WYOR300W 309 nt5.84□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 APE3YBR286W 1614 nt5.84□□□□□ -1.47
PEX11Q12462 YDR109CYDR109C 2148 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 MDH3YDL078C 1032 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 YDL119CYDL119C 924 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 DJP1YIR004W 1299 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 RPE1YJL121C 717 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SSP120YLR250W 705 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 YNR040WYNR040W 771 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 YOL163WYOL163W 510 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 CLN1YMR199W 1641 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SGE1YPR198W 1632 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 DAL4YIR028W 1908 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 CDC19YAL038W 1503 nt5.83□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 GIT1YCR098C 1557 nt5.82□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 snR82snR82 268 nt5.82□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 GPI11YDR302W 660 nt5.82□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 CBP4YGR174C 513 nt5.82□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 RPS9AYPL081W 594 nt5.82□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SGV1YPR161C 1974 nt5.82□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 RSP5YER125W 2430 nt5.82□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 MNN5YJL186W 1761 nt5.81□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 RRP4YHR069C 1080 nt5.81□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.81□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.81□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.81□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.81□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.81□□□□□ -1.48
PEX11Q12462 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.81□□□□□ -1.48
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