Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A3P48751 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A3P48751 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A3P48751 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms