Protein–RNA interactions for Protein: P47821

SSN8, RNA polymerase II holoenzyme cyclin-like subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSN8P47821 LDB7YBL006C 543 nt5.66□□□□□ -1.5
SSN8P47821 DFR1YOR236W 636 nt5.66□□□□□ -1.5
SSN8P47821 MOD5YOR274W 1287 nt5.66□□□□□ -1.5
SSN8P47821 EDE1YBL047C 4146 nt5.66□□□□□ -1.5
SSN8P47821 RRN3YKL125W 1884 nt5.66□□□□□ -1.5
SSN8P47821 HEM1YDR232W 1647 nt5.66□□□□□ -1.5
SSN8P47821 CRP1YHR146W 1398 nt5.66□□□□□ -1.5
SSN8P47821 COX10YPL172C 1389 nt5.66□□□□□ -1.5
SSN8P47821 PDR18YNR070W 4002 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 OPT1YJL212C 2400 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 RHO3YIL118W 696 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 REV7YIL139C 738 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 HOC1YJR075W 1191 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 MIA40YKL195W 1212 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 YKL223WYKL223W 333 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 MRPL10YNL284C 969 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 RDL2YOR286W 450 nt5.65□□□□□ -1.5
SSN8P47821 BIO3YNR058W 1443 nt5.65□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YNL095CYNL095C 1929 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YDR401WYDR401W 564 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YPT1YFL038C 621 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YGR176WYGR176W 348 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YHR145CYHR145C 357 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YJL193WYJL193W 1209 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YKL077WYKL077W 1179 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 RFC4YOL094C 972 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 CLP1YOR250C 1338 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 UTR2YEL040W 1404 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 RAD53YPL153C 2466 nt5.64□□□□□ -1.51
SSN8P47821 PWP1YLR196W 1731 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 RGT1YKL038W 3513 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 KEX2YNL238W 2445 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 MPH3YJR160C 1809 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 LIA1YJR070C 978 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 RNH1YMR234W 1047 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 snR32snR32 188 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 PLB3YOL011W 2061 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 GSY2YLR258W 2118 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YHK8YHR048W 1545 nt5.63□□□□□ -1.51
SSN8P47821 ACS2YLR153C 2052 nt5.62□□□□□ -1.51
SSN8P47821 KSH1YNL024C-A 219 nt5.62□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.62□□□□□ -1.51
SSN8P47821 IME2YJL106W 1938 nt5.62□□□□□ -1.51
SSN8P47821 GUF1YLR289W 1938 nt5.62□□□□□ -1.51
SSN8P47821 EPS1YIL005W 2106 nt5.62□□□□□ -1.51
SSN8P47821 MSN2YMR037C 2115 nt5.62□□□□□ -1.51
SSN8P47821 BUD14YAR014C 2130 nt5.61□□□□□ -1.51
SSN8P47821 CRH1YGR189C 1524 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 CHL4YDR254W 1377 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 ATG23YLR431C 1362 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 DMA1YHR115C 1251 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YRB2YIL063C 984 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 ASF1YJL115W 840 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YJR146WYJR146W 354 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 FBA1YKL060C 1080 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YKL102CYKL102C 306 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 MRPL23YOR150W 492 nt5.6□□□□□ -1.51
SSN8P47821 VRP1YLR337C 2454 nt5.59□□□□□ -1.51
SSN8P47821 ZWF1YNL241C 1518 nt5.59□□□□□ -1.51
SSN8P47821 GPD1YDL022W 1176 nt5.59□□□□□ -1.51
SSN8P47821 FMO1YHR176W 1299 nt5.59□□□□□ -1.51
SSN8P47821 PUS4YNL292W 1212 nt5.59□□□□□ -1.51
SSN8P47821 TSR3YOR006C 942 nt5.59□□□□□ -1.51
SSN8P47821 YPL257WYPL257W 582 nt5.59□□□□□ -1.51
SSN8P47821 CYS4YGR155W 1524 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 FAL1YDR021W 1200 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 PHM8YER037W 966 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YAR064WYAR064W 300 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YHM2YMR241W 945 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YNL120CYNL120C 486 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 TAE1YBR261C 699 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 MID1YNL291C 1647 nt5.58□□□□□ -1.52
SSN8P47821 THI2YBR240C 1353 nt5.57□□□□□ -1.52
SSN8P47821 MRPL1YDR116C 858 nt5.57□□□□□ -1.52
SSN8P47821 RPP1YHR062C 882 nt5.57□□□□□ -1.52
SSN8P47821 SQT1YIR012W 1296 nt5.57□□□□□ -1.52
SSN8P47821 OGG1YML060W 1131 nt5.57□□□□□ -1.52
SSN8P47821 LSC1YOR142W 990 nt5.57□□□□□ -1.52
SSN8P47821 DBF4YDR052C 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
SSN8P47821 ENP1YBR247C 1452 nt5.57□□□□□ -1.52
SSN8P47821 PRP24YMR268C 1335 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 PRY3YJL078C 2646 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 MRPL35YDR322W 1104 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YDR396WYDR396W 501 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 LCL3YGL085W 825 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 DID2YKR035W-A 615 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 RUF23RUF23 254 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 RRT2YBR246W 1164 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 MNN2YBR015C 1794 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 PYC1YGL062W 3537 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 MSY1YPL097W 1479 nt5.56□□□□□ -1.52
SSN8P47821 MCX1YBR227C 1563 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 CYK3YDL117W 2658 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 ERC1YHR032W 1746 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 YDL023CYDL023C 321 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 HEM2YGL040C 1029 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 SOH1YGL127C 384 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 BUD32YGR262C 786 nt5.55□□□□□ -1.52
SSN8P47821 LYS1YIR034C 1122 nt5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.1 ms