Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 MRP51YPL118W 1035 nt6.33□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 YOL036WYOL036W 2286 nt6.33□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 AIM17YHL021C 1398 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 YMR279CYMR279C 1623 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 LPL1YOR059C 1353 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 TPO3YPR156C 1869 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 DOC1YGL240W 753 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 JJJ3YJR097W 519 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 ADD66YKL206C 804 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 POS5YPL188W 1245 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 YMR027WYMR027W 1413 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 CRZ1YNL027W 2037 nt6.32□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 HAS1YMR290C 1518 nt6.31□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 YHR020WYHR020W 2067 nt6.31□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 MRPS28YDR337W 861 nt6.31□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 MIA40YKL195W 1212 nt6.31□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 TIF34YMR146C 1044 nt6.31□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 MST1YKL194C 1389 nt6.31□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 IMG2YCR071C 441 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 PEX7YDR142C 1128 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 MRP1YDR347W 966 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 ATG36YJL185C 882 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 SLG1YOR008C 1137 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 UTR2YEL040W 1404 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 DUG1YFR044C 1446 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 MPC54YOR177C 1395 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 KEL1YHR158C 3495 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 STT3YGL022W 2157 nt6.3□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 NOP7YGR103W 1818 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 PCL9YDL179W 915 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 ADK2YER170W 678 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 AAD6YFL056C 639 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 CDC11YJR076C 1248 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 FBA1YKL060C 1080 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 YML6YML025C 861 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 RNH1YMR234W 1047 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 GET4YOR164C 939 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 TRP5YGL026C 2124 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 GUF1YLR289W 1938 nt6.29□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 MMR1YLR190W 1476 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 WTM1YOR230W 1314 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 SCT1YBL011W 2280 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 GEX1YCL073C 1848 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 GEX2YKR106W 1848 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 OAC1YKL120W 975 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 DUS4YLR405W 1104 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 CWC27YPL064C 906 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 CRP1YHR146W 1398 nt6.28□□□□□ -1.4
SSZ1P38788 EDE1YBL047C 4146 nt6.27□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 RAM1YDL090C 1296 nt6.27□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YFR006WYFR006W 1608 nt6.27□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 ATG32YIL146C 1590 nt6.27□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 GPB2YAL056W 2643 nt6.27□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 LAT1YNL071W 1449 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 PPM2YOL141W 2088 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 RTT103YDR289C 1230 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 RPP1YHR062C 882 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 RHO4YKR055W 876 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 PML1YLR016C 615 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 GEP5YLR091W 882 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YGP1YNL160W 1065 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 VRP1YLR337C 2454 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 THI2YBR240C 1353 nt6.26□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 AFG1YEL052W 1530 nt6.25□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YDL023CYDL023C 321 nt6.25□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YDL129WYDL129W 876 nt6.25□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 SPG1YGR236C 288 nt6.25□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 SQT1YIR012W 1296 nt6.25□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 HTZ1YOL012C 405 nt6.25□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 PUP1YOR157C 786 nt6.25□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 PDR18YNR070W 4002 nt6.25□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 ATG7YHR171W 1893 nt6.24□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 PRP46YPL151C 1356 nt6.24□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 TIM22YDL217C 624 nt6.24□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YNR005CYNR005C 405 nt6.24□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 TMA46YOR091W 1038 nt6.24□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 TAH18YPR048W 1872 nt6.24□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 MTC5YDR128W 3447 nt6.24□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 APE4YHR113W 1473 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 HSP104YLL026W 2727 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 FAT3YKL187C 2253 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 PFK2YMR205C 2880 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 HEM2YGL040C 1029 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 DMA1YHR115C 1251 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YLR123CYLR123C 330 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YLR312CYLR312C 1197 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YML079WYML079W 606 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YPR130CYPR130C 408 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 STB5YHR178W 2232 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YML133CYML133C 4125 nt6.23□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 GPI11YDR302W 660 nt6.22□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.22□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 PSR2YLR019W 1194 nt6.22□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 NMD4YLR363C 657 nt6.22□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 TSR3YOR006C 942 nt6.22□□□□□ -1.41
SSZ1P38788 PRY3YJL078C 2646 nt6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms