Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC3O15234 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC3O15234 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC3O15234 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC3O15234 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC3O15234 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC3O15234 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC3O15234 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC3O15234 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC3O15234 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASC3O15234 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC3O15234 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC3O15234 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC3O15234 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC3O15234 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC3O15234 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASC3O15234 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC3O15234 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC3O15234 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC3O15234 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC3O15234 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASC3O15234 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC3O15234 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC3O15234 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASC3O15234 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASC3O15234 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC3O15234 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC3O15234 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC3O15234 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC3O15234 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASC3O15234 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC3O15234 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC3O15234 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC3O15234 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC3O15234 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASC3O15234 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC3O15234 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC3O15234 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC3O15234 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC3O15234 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC3O15234 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC3O15234 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASC3O15234 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASC3O15234 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC3O15234 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASC3O15234 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASC3O15234 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASC3O15234 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASC3O15234 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASC3O15234 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASC3O15234 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASC3O15234 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASC3O15234 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASC3O15234 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASC3O15234 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASC3O15234 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC3O15234 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC3O15234 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC3O15234 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC3O15234 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC3O15234 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC3O15234 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC3O15234 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASC3O15234 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC3O15234 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC3O15234 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC3O15234 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASC3O15234 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC3O15234 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC3O15234 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC3O15234 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC3O15234 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASC3O15234 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms