Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRMT12Q53H54 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms