Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRMT12Q53H54 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms