Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3KBP1Q96B97 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3KBP1Q96B97 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3KBP1Q96B97 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms