Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PROX2Q3B8N5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PROX2Q3B8N5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PROX2Q3B8N5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms