Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 CCT3YJL014W 1605 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 POR2YIL114C 846 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 YIR043CYIR043C 693 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 YNL228WYNL228W 777 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 RCK1YGL158W 1539 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 STT3YGL022W 2157 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 VPS72YDR485C 2388 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 MPA43YNL249C 1629 nt7.6□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 DAL4YIR028W 1908 nt7.59□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 GAL83YER027C 1254 nt7.59□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 HIS1YER055C 894 nt7.59□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 TSR2YLR435W 618 nt7.59□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 YNL234WYNL234W 1281 nt7.59□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 YNL247WYNL247W 2304 nt7.59□□□□□ -1.19
SSF2Q12153 MMS2YGL087C 414 nt7.58□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 MAD2YJL030W 591 nt7.58□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 GCV3YAL044C 513 nt7.58□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YKR045CYKR045C 552 nt7.58□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.58□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YMR252CYMR252C 405 nt7.58□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 MKK1YOR231W 1527 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 GPD2YOL059W 1323 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 PRY3YJL078C 2646 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 VMA3YEL027W 483 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 NTG1YAL015C 1200 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YJR146WYJR146W 354 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 GCN3YKR026C 918 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YLR184WYLR184W 348 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 TIP41YPR040W 1071 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 PTR2YKR093W 1806 nt7.57□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 EDE1YBL047C 4146 nt7.56□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 SRL2YLR082C 1179 nt7.56□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 KSH1YNL024C-A 219 nt7.56□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YNR014WYNR014W 639 nt7.56□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YBR027CYBR027C 333 nt7.56□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 OSW2YLR054C 2175 nt7.56□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 CCT8YJL008C 1707 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 GUF1YLR289W 1938 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 SNF11YDR073W 510 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YEA6YEL006W 1008 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YEL074WYEL074W 339 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 SPO12YHR152W 522 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 CDC11YJR076C 1248 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 RUF23RUF23 254 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 ODC2YOR222W 924 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 OPI11YPR044C 354 nt7.55□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 UIP5YKR044W 1332 nt7.54□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 PPH22YDL188C 1134 nt7.54□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 FAL1YDR021W 1200 nt7.54□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 OGG1YML060W 1131 nt7.54□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YBL070CYBL070C 321 nt7.54□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 CTF19YPL018W 1110 nt7.54□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.54□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 PMT2YAL023C 2280 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 TFG2YGR005C 1203 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 GTO1YGR154C 1071 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 LYS1YIR034C 1122 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 MIA40YKL195W 1212 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 DRE2YKR071C 1047 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YPL257WYPL257W 582 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 PEX31YGR004W 1389 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 SLA2YNL243W 2907 nt7.53□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 SRF1YDL133W 1314 nt7.52□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 GSH1YJL101C 2037 nt7.52□□□□□ -1.2
SSF2Q12153 YEF1YEL041W 1488 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 GYP8YFL027C 1494 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 AIM17YHL021C 1398 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 YDR187CYDR187C 519 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 DID2YKR035W-A 615 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 PEX12YMR026C 1200 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 DFR1YOR236W 636 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 ZWF1YNL241C 1518 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 HSM3YBR272C 1443 nt7.52□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 TOS2YGR221C 1869 nt7.51□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 YDR415CYDR415C 1125 nt7.51□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 JJJ3YJR097W 519 nt7.51□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 DBR1YKL149C 1218 nt7.51□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 TAE1YBR261C 699 nt7.51□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 MSB3YNL293W 1902 nt7.5□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 CDC1YDR182W 1476 nt7.5□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 AFG2YLR397C 2343 nt7.5□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 GGC1YDL198C 903 nt7.5□□□□□ -1.21
SSF2Q12153 SRG1SRG1 551 nt7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.8 ms