Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 POP1YNL221C 2628 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 LAT1YNL071W 1449 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 MRC1YCL061C 3291 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 RPL7AYGL076C 735 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 RRP46YGR095C 672 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 YIR042CYIR042C 711 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 YNL017CYNL017C 339 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 YOL163WYOL163W 510 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 RPL7BYPL198W 735 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 IVY1YDR229W 1362 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 ARE2YNR019W 1929 nt6.03□□□□□ -1.44
YMR226CQ05016 YGR127WYGR127W 939 nt6.02□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 AIM46YHR199C 933 nt6.02□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 MNN5YJL186W 1761 nt6.02□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 MTC5YDR128W 3447 nt6.02□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 HXT17YNR072W 1695 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 HIS7YBR248C 1659 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 HRQ1YDR291W 3234 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 YFL042CYFL042C 2025 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 VMA3YEL027W 483 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 YGL235WYGL235W 537 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 YOX1YML027W 1158 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 ZIM17YNL310C 525 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 CTF19YPL018W 1110 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 COX15YER141W 1461 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 VHT1YGR065C 1782 nt6.01□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 CNE1YAL058W 1509 nt6□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 PET112YBL080C 1626 nt6□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 SLX5YDL013W 1860 nt5.99□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 GDA1YEL042W 1557 nt5.99□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 YKL102CYKL102C 306 nt5.99□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 YMC1YPR058W 924 nt5.99□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 IFA38YBR159W 1044 nt5.99□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 TEP1YNL128W 1305 nt5.99□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 FMP40YPL222W 2067 nt5.98□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 SPS22YCL048W 1392 nt5.97□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 TMT1YER175C 900 nt5.97□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 RPR1RPR1 369 nt5.97□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 MRPS12YNR036C 462 nt5.97□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 DAP1YPL170W 459 nt5.97□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 GLN1YPR035W 1113 nt5.97□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 PAT1YCR077C 2391 nt5.97□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 EXG1YLR300W 1347 nt5.97□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 PYC2YBR218C 3543 nt5.96□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 YFL052WYFL052W 1398 nt5.96□□□□□ -1.45
YMR226CQ05016 FRE5YOR384W 2085 nt5.96□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 PTK2YJR059W 2457 nt5.96□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 AMA1YGR225W 1782 nt5.95□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 VTH1YIL173W 4650 nt5.95□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 VTH2YJL222W 4650 nt5.95□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 CRH1YGR189C 1524 nt5.95□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 CCT8YJL008C 1707 nt5.95□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 RPE1YJL121C 717 nt5.95□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.95□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 THI4YGR144W 981 nt5.94□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 SRL2YLR082C 1179 nt5.94□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 GTO3YMR251W 1101 nt5.94□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 PPT1YGR123C 1542 nt5.94□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 ALD6YPL061W 1503 nt5.94□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 KEX2YNL238W 2445 nt5.94□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 BZZ1YHR114W 1902 nt5.93□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 CMR1YDL156W 1569 nt5.93□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 CDC16YKL022C 2523 nt5.93□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 MSO1YNR049C 633 nt5.93□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 VMA4YOR332W 702 nt5.93□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 RPT3YDR394W 1287 nt5.92□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 FMO1YHR176W 1299 nt5.92□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 ASF1YJL115W 840 nt5.92□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 LSC1YOR142W 990 nt5.92□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 LGE1YPL055C 999 nt5.92□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 IRS4YKR019C 1848 nt5.92□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 GAA1YLR088W 1845 nt5.92□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 AMD2YDR242W 1650 nt5.91□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 MSN2YMR037C 2115 nt5.91□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 PTC4YBR125C 1182 nt5.91□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 CLB1YGR108W 1416 nt5.91□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 MSS1YMR023C 1581 nt5.9□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 HOC1YJR075W 1191 nt5.9□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 CCP1YKR066C 1086 nt5.9□□□□□ -1.46
YMR226CQ05016 YTP1YNL237W 1380 nt5.9□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 CHS5YLR330W 2016 nt5.89□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 YCK1YHR135C 1617 nt5.89□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 CDC11YJR076C 1248 nt5.89□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 MCP1YOR228C 909 nt5.89□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 RIX7YLL034C 2514 nt5.89□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 YLL067CYLL067C 3618 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 RPL10YLR075W 666 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 PRE5YMR314W 705 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 GUD1YDL238C 1470 nt5.88□□□□□ -1.47
YMR226CQ05016 BUG1YDL099W 1026 nt5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.6 ms