Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD8P48556 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD8P48556 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMD8P48556 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD8P48556 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms