Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 CDC16YKL022C 2523 nt6.78□□□□□ -1.32
VFA1P40080 SDH4YDR178W 546 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YDR187CYDR187C 519 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YDR278CYDR278C 318 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 RPS3YNL178W 723 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YBL112CYBL112C 318 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 OST3YOR085W 1053 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YOR111WYOR111W 699 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YBR226CYBR226C 411 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 RBS1YDL189W 1374 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 ELP3YPL086C 1674 nt6.77□□□□□ -1.33
VFA1P40080 EXG1YLR300W 1347 nt6.76□□□□□ -1.33
VFA1P40080 ILV1YER086W 1731 nt6.76□□□□□ -1.33
VFA1P40080 CIS3YJL158C 684 nt6.76□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.76□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YMC1YPR058W 924 nt6.76□□□□□ -1.33
VFA1P40080 ADE17YMR120C 1779 nt6.76□□□□□ -1.33
VFA1P40080 RIX7YLL034C 2514 nt6.76□□□□□ -1.33
VFA1P40080 TKL2YBR117C 2046 nt6.76□□□□□ -1.33
VFA1P40080 TPO3YPR156C 1869 nt6.75□□□□□ -1.33
VFA1P40080 AIM20YIL158W 615 nt6.75□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YMR252CYMR252C 405 nt6.75□□□□□ -1.33
VFA1P40080 PFK2YMR205C 2880 nt6.75□□□□□ -1.33
VFA1P40080 IMA5YJL216C 1746 nt6.75□□□□□ -1.33
VFA1P40080 BUD9YGR041W 1644 nt6.75□□□□□ -1.33
VFA1P40080 MRPL1YDR116C 858 nt6.74□□□□□ -1.33
VFA1P40080 CUP2YGL166W 678 nt6.74□□□□□ -1.33
VFA1P40080 MPC2YHR162W 390 nt6.74□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YNL017CYNL017C 339 nt6.74□□□□□ -1.33
VFA1P40080 HMT1YBR034C 1047 nt6.74□□□□□ -1.33
VFA1P40080 TAE1YBR261C 699 nt6.74□□□□□ -1.33
VFA1P40080 AVT4YNL101W 2142 nt6.74□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YEL023CYEL023C 2049 nt6.74□□□□□ -1.33
VFA1P40080 BIM1YER016W 1035 nt6.73□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YGL235WYGL235W 537 nt6.73□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YJR084WYJR084W 1272 nt6.73□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YKL153WYKL153W 510 nt6.73□□□□□ -1.33
VFA1P40080 MCH1YDL054C 1461 nt6.73□□□□□ -1.33
VFA1P40080 ATG23YLR431C 1362 nt6.72□□□□□ -1.33
VFA1P40080 RAD59YDL059C 717 nt6.72□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.72□□□□□ -1.33
VFA1P40080 TIF2YJL138C 1188 nt6.72□□□□□ -1.33
VFA1P40080 TIF1YKR059W 1188 nt6.72□□□□□ -1.33
VFA1P40080 YCK1YHR135C 1617 nt6.72□□□□□ -1.33
VFA1P40080 SCS22YBL091C-A 528 nt6.71□□□□□ -1.34
VFA1P40080 SLD7YOR060C 774 nt6.71□□□□□ -1.34
VFA1P40080 DAP1YPL170W 459 nt6.71□□□□□ -1.34
VFA1P40080 PYC2YBR218C 3543 nt6.71□□□□□ -1.34
VFA1P40080 OSW2YLR054C 2175 nt6.71□□□□□ -1.34
VFA1P40080 YPR196WYPR196W 1413 nt6.7□□□□□ -1.34
VFA1P40080 RRP46YGR095C 672 nt6.7□□□□□ -1.34
VFA1P40080 ICT1YLR099C 1185 nt6.7□□□□□ -1.34
VFA1P40080 YML083CYML083C 1257 nt6.7□□□□□ -1.34
VFA1P40080 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.7□□□□□ -1.34
VFA1P40080 YNL200CYNL200C 741 nt6.7□□□□□ -1.34
VFA1P40080 GDA1YEL042W 1557 nt6.69□□□□□ -1.34
VFA1P40080 YHL017WYHL017W 1599 nt6.69□□□□□ -1.34
VFA1P40080 EFM3YJR129C 1020 nt6.69□□□□□ -1.34
VFA1P40080 HOS2YGL194C 1359 nt6.69□□□□□ -1.34
VFA1P40080 CDC1YDR182W 1476 nt6.68□□□□□ -1.34
VFA1P40080 ECM14YHR132C 1293 nt6.68□□□□□ -1.34
VFA1P40080 AAT2YLR027C 1257 nt6.68□□□□□ -1.34
VFA1P40080 SCO2YBR024W 906 nt6.68□□□□□ -1.34
VFA1P40080 YML133CYML133C 4125 nt6.68□□□□□ -1.34
VFA1P40080 RVB2YPL235W 1416 nt6.67□□□□□ -1.34
VFA1P40080 COS6YGR295C 1146 nt6.67□□□□□ -1.34
VFA1P40080 REV7YIL139C 738 nt6.67□□□□□ -1.34
VFA1P40080 VPS24YKL041W 675 nt6.67□□□□□ -1.34
VFA1P40080 AVO2YMR068W 1281 nt6.67□□□□□ -1.34
VFA1P40080 PET112YBL080C 1626 nt6.67□□□□□ -1.34
VFA1P40080 FET4YMR319C 1659 nt6.67□□□□□ -1.34
VFA1P40080 GUD1YDL238C 1470 nt6.66□□□□□ -1.34
VFA1P40080 YDR401WYDR401W 564 nt6.66□□□□□ -1.34
VFA1P40080 HAL5YJL165C 2568 nt6.66□□□□□ -1.34
VFA1P40080 GFA1YKL104C 2154 nt6.66□□□□□ -1.34
VFA1P40080 TEP1YNL128W 1305 nt6.66□□□□□ -1.34
VFA1P40080 POX1YGL205W 2247 nt6.66□□□□□ -1.34
VFA1P40080 CEF1YMR213W 1773 nt6.65□□□□□ -1.34
VFA1P40080 STF1YDL130W-A 261 nt6.65□□□□□ -1.34
VFA1P40080 MDH1YKL085W 1005 nt6.65□□□□□ -1.34
VFA1P40080 PSR2YLR019W 1194 nt6.65□□□□□ -1.34
VFA1P40080 YML6YML025C 861 nt6.65□□□□□ -1.34
VFA1P40080 AST1YBL069W 1290 nt6.65□□□□□ -1.34
VFA1P40080 OCA1YNL099C 717 nt6.65□□□□□ -1.34
VFA1P40080 RRS1YOR294W 612 nt6.65□□□□□ -1.34
VFA1P40080 VMA2YBR127C 1554 nt6.65□□□□□ -1.35
VFA1P40080 RAP1YNL216W 2484 nt6.65□□□□□ -1.35
VFA1P40080 SIR2YDL042C 1689 nt6.65□□□□□ -1.35
VFA1P40080 NHA1YLR138W 2958 nt6.64□□□□□ -1.35
VFA1P40080 YOL036WYOL036W 2286 nt6.64□□□□□ -1.35
VFA1P40080 COX9YDL067C 180 nt6.64□□□□□ -1.35
VFA1P40080 PPM1YDR435C 987 nt6.64□□□□□ -1.35
VFA1P40080 YMR122CYMR122C 375 nt6.64□□□□□ -1.35
VFA1P40080 PRP24YMR268C 1335 nt6.64□□□□□ -1.35
VFA1P40080 PGK1YCR012W 1251 nt6.63□□□□□ -1.35
VFA1P40080 CRF1YDR223W 1404 nt6.63□□□□□ -1.35
VFA1P40080 SRN2YLR119W 642 nt6.63□□□□□ -1.35
VFA1P40080 YMR147WYMR147W 672 nt6.63□□□□□ -1.35
VFA1P40080 WHI2YOR043W 1461 nt6.63□□□□□ -1.35
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