Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	ROG3	YFR022W	2202 nt		4.99	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	FBA1	YKL060C	1080 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	MSN2	YMR037C	2115 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	YPL250W-A	YPL250W-A	288 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	ASR1	YPR093C	867 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	TAH18	YPR048W	1872 nt		4.98	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	ECM3	YOR092W	1842 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	MCP1	YOR228C	909 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	DFR1	YOR236W	636 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	MCM6	YGL201C	3054 nt		4.97	□□□□□ -1.61
VAR1	P02381	COX15	YER141W	1461 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	GUF1	YLR289W	1938 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	CDC11	YJR076C	1248 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YJR146W	YJR146W	354 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	RPS28A	YOR167C	204 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	SPE3	YPR069C	882 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	SUE1	YPR151C	621 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	PMT3	YOR321W	2262 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YHK8	YHR048W	1545 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	CCC2	YDR270W	3015 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	VPS1	YKR001C	2115 nt		4.96	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	CHL4	YDR254W	1377 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	THI2	YBR240C	1353 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	NAS6	YGR232W	687 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	RPP1	YHR062C	882 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	OGG1	YML060W	1131 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	RNH1	YMR234W	1047 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YNL120C	YNL120C	486 nt		4.95	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	SSK1	YLR006C	2139 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	IVY1	YDR229W	1362 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	GPA2	YER020W	1350 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YRB2	YIL063C	984 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	SQT1	YIR012W	1296 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	ODC2	YOR222W	924 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	GAA1	YLR088W	1845 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	UTR2	YEL040W	1404 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	MSY1	YPL097W	1479 nt		4.94	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	STB5	YHR178W	2232 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YHR213W-B	YHR213W-B	300 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	HOC1	YJR075W	1191 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YKL077W	YKL077W	1179 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YKL102C	YKL102C	306 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YAR064W	YAR064W	300 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	LDB7	YBL006C	543 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	AAD14	YNL331C	1131 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	MOD5	YOR274W	1287 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	PEX3	YDR329C	1326 nt		4.93	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	PYK2	YOR347C	1521 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	PFK2	YMR205C	2880 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	FMP40	YPL222W	2067 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YDR396W	YDR396W	501 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	LIA1	YJR070C	978 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	RUF23	RUF23	254 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	MRPL23	YOR150W	492 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YPL257W	YPL257W	582 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	OXP1	YKL215C	3861 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	MKK2	YPL140C	1521 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	BIO3	YNR058W	1443 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	GPI11	YDR302W	660 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	HEM2	YGL040C	1029 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	NPA3	YJR072C	1158 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	URA1	YKL216W	945 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	YNL108C	YNL108C	813 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	MRPL10	YNL284C	969 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	CRP1	YHR146W	1398 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	CLB2	YPR119W	1476 nt		4.9	□□□□□ -1.62
VAR1	P02381	FAL1	YDR021W	1200 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	SOH1	YGL127C	384 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YLR123C	YLR123C	330 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	COS10	YNR075W	1125 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	GPD1	YDL022W	1176 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	MRPL35	YDR322W	1104 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YGR176W	YGR176W	348 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	LYS1	YIR034C	1122 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	AIM24	YJR080C	1185 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	DID2	YKR035W-A	615 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	TSR3	YOR006C	942 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	VPS5	YOR069W	2028 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	PLB3	YOL011W	2061 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	AMA1	YGR225W	1782 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	PTK2	YJR059W	2457 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	CRH1	YGR189C	1524 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	MPM1	YJL066C	759 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	ASF1	YJL115W	840 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	PDR18	YNR070W	4002 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	MPH3	YJR160C	1809 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	MAL11	YGR289C	1851 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	CYS4	YGR155W	1524 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	DBP9	YLR276C	1785 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	RKI1	YOR095C	777 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	LSC1	YOR142W	990 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	LDB16	YCL005W	771 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	VPS70	YJR126C	2436 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	VMA3	YEL027W	483 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	FMO1	YHR176W	1299 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	RHO3	YIL118W	696 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	MDE1	YJR024C	735 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	ICT1	YLR099C	1185 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YLR312C	YLR312C	1197 nt		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.4 ms