Protein–RNA interactions for Protein: B2RUY7

VWC2L, von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2LB2RUY7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VWC2LB2RUY7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VWC2LB2RUY7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VWC2LB2RUY7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms