Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC182A6NF36 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC182A6NF36 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC182A6NF36 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms