Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCE3A1L190 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCE3A1L190 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms