Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 MIR663AHG-221ENST00000600225 473 ntTSL 513.81□□□□□ -0.26e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SLC25A10-206ENST00000573246 898 ntTSL 313.75□□□□□ -0.216e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-215ENST00000597361 586 ntTSL 513.61□□□□□ -0.236e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-219ENST00000598451 511 ntTSL 513.61□□□□□ -0.236e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.246e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-224ENST00000601119 750 ntTSL 513.22□□□□□ -0.296e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 512.74□□□□□ -0.376e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 512.3□□□□□ -0.446e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 512.12□□□□□ -0.476e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.486e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-9■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TTC28-203ENST00000442232 499 ntTSL 211.79□□□□□ -0.526e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.566e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-229ENST00000638264 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.586e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-217ENST00000616545 920 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.586e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-226ENST00000621790 1008 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.586e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-221ENST00000619555 682 ntTSL 511.13□□□□□ -0.636e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 EHBP1-220ENST00000496857 1262 ntTSL 1 (best)10.91□□□□□ -0.666e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.666e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-216ENST00000568664 341 ntTSL 510.83□□□□□ -0.686e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.696e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-223ENST00000620632 706 ntTSL 310.65□□□□□ -0.76e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TERF2-205ENST00000566750 917 ntTSL 210.61□□□□□ -0.716e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 510.5□□□□□ -0.736e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-230ENST00000639083 2269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.776e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.776e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-214ENST00000566266 3174 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.776e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-230ENST00000609012 708 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.86e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-211ENST00000610369 563 ntTSL 59.67□□□□□ -0.866e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-218ENST00000617172 980 ntTSL 59.67□□□□□ -0.866e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-205ENST00000561675 486 ntTSL 39.46□□□□□ -0.96e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-227ENST00000622057 706 ntTSL 59.32□□□□□ -0.926e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TERF2-209ENST00000569280 513 ntTSL 59.3□□□□□ -0.926e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.946e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TERF2-212ENST00000569611 556 ntTSL 48.98□□□□□ -0.976e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -16e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TERF2-208ENST00000567841 554 ntTSL 48.6□□□□□ -1.036e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-207ENST00000564392 479 ntTSL 38.49□□□□□ -1.056e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SNHG3-201ENST00000413987 2201 ntTSL 1 (best)8.41□□□□□ -1.066e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TERF2-210ENST00000569542 431 ntTSL 58.29□□□□□ -1.086e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ITIH2-206ENST00000480387 573 ntTSL 37.87□□□□□ -1.156e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-213ENST00000611963 739 ntTSL 57.82□□□□□ -1.166e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ITIH2-203ENST00000429820 767 ntTSL 37.6□□□□□ -1.196e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.236e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-210ENST00000596223 691 ntTSL 57.34□□□□□ -1.236e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-216ENST00000614494 515 ntTSL 57.29□□□□□ -1.246e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.333e-9■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-232ENST00000609202 816 ntTSL 55.23□□□□□ -1.576e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-202ENST00000432499 1129 ntTSL 54.72□□□□□ -1.656e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ZZZ3-204ENST00000433749 603 ntTSL 44.64□□□□□ -1.676e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 AL109811.4-202ENST00000611136 700 ntTSL 54.29□□□□□ -1.726e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 CFDP1-211ENST00000612761 395 ntTSL 34.26□□□□□ -1.736e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TERF2-204ENST00000566257 669 ntTSL 54.14□□□□□ -1.756e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 CFDP1-208ENST00000569341 454 ntTSL 33.82□□□□□ -1.86e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 CFDP1-210ENST00000570279 349 ntTSL 33.82□□□□□ -1.86e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ZZZ3-207ENST00000469944 686 ntTSL 33.6□□□□□ -1.836e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 53.2□□□□□ -1.96e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.946e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.196e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.051e-48■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-48■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIIP-207ENST00000498685 1392 ntTSL 217.38■□□□□ 0.375e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MIIP-203ENST00000466860 1709 ntTSL 517.04■□□□□ 0.325e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -05e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MIIP-205ENST00000478749 779 ntTSL 214.98□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.243e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.156e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 SLC30A5-204ENST00000504103 382 ntTSL 321.74■■□□□ 1.076e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TSC22D4-206ENST00000496728 837 ntTSL 320.01■□□□□ 0.796e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.716e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.626e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.356e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.5■□□□□ 0.236e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.156e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.146e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.126e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.116e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 06e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.086e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.126e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.796e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.356e-6■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.399e-9■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.129e-9■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.489e-9■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.529e-9■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.549e-9■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 POFUT2-208ENST00000471540 3176 ntTSL 511.18□□□□□ -0.629e-9■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.063e-8■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MICAL3-207ENST00000461307 5981 ntTSL 512.57□□□□□ -0.43e-8■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MICAL3-210ENST00000495076 5113 ntTSL 511.02□□□□□ -0.653e-8■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-8■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 MICAL3-204ENST00000414725 4756 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.743e-8■□□□□ 8.5
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