Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT12Q53H54 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms