Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SDCBP2-AS1-205ENST00000609745 855 ntTSL 413.48□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.711e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-221ENST00000534372 544 ntTSL 510.47□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 808 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.911e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-218ENST00000530064 625 ntTSL 57.83□□□□□ -1.161e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-219ENST00000531291 572 ntTSL 57.55□□□□□ -1.21e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.221e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-216ENST00000528968 587 ntTSL 56.81□□□□□ -1.321e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-220ENST00000532325 526 ntTSL 55.5□□□□□ -1.531e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-217ENST00000529361 555 ntTSL 55.39□□□□□ -1.551e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.565e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 ZZZ3-210ENST00000476275 4737 ntTSL 25.16□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 ATF7IP2-215ENST00000568027 3406 ntTSL 1 (best)5.02□□□□□ -1.615e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.655e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-202ENST00000399614 594 ntTSL 44.22□□□□□ -1.731e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-204ENST00000448187 888 ntTSL 53.86□□□□□ -1.791e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 ZZZ3-211ENST00000481346 4500 ntTSL 1 (best)3.39□□□□□ -1.871e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-205ENST00000455338 352 ntTSL 52.28□□□□□ -2.041e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 LINC02001-201ENST00000592381 1298 ntTSL 214.83□□□□□ -0.041e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 LINC02001-202ENST00000638682 1504 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.691e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 MSH5-213ENST00000468136 690 ntTSL 29.81□□□□□ -0.842e-9■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 EXO1-203ENST00000423131 950 ntTSL 516.77■□□□□ 0.285e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 EXO1-206ENST00000469419 754 ntTSL 310.28□□□□□ -0.765e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 EXO1-207ENST00000493702 783 ntTSL 510.02□□□□□ -0.815e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 EXO1-212ENST00000523590 621 ntTSL 55.99□□□□□ -1.455e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 EXO1-204ENST00000437497 593 ntTSL 35.29□□□□□ -1.565e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 EXO1-205ENST00000450748 607 ntTSL 34.13□□□□□ -1.755e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-10■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.356e-15■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.146e-15■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -06e-15■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 AL662899.3-203ENST00000409691 1903 ntTSL 313.96□□□□□ -0.178e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 LY6G5B-209ENST00000471088 677 ntTSL 511.87□□□□□ -0.518e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 LY6G5B-208ENST00000409525 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.618e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.718e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.718e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.663e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 EML4-208ENST00000482660 584 ntTSL 417.72■□□□□ 0.437e-8■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SLC2A1-AS1-201ENST00000416689 3075 ntTSL 211.1□□□□□ -0.635e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 RNF44-208ENST00000515051 596 ntTSL 412.02□□□□□ -0.497e-7■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 530.51■■■□□ 2.476e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 26e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.86e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-214ENST00000597267 653 ntTSL 524.14■■□□□ 1.456e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.396e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.36e-6■□□□□ 8.6
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ILF3Q12906 MIR663AHG-228ENST00000608487 486 ntTSL 522.77■■□□□ 1.246e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.246e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-223ENST00000601079 613 ntTSL 522.7■■□□□ 1.226e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-206ENST00000594150 693 ntTSL 521.87■■□□□ 1.096e-6■□□□□ 8.6
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ILF3Q12906 MIR663AHG-216ENST00000597979 568 ntTSL 521.06■□□□□ 0.966e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-229ENST00000608521 553 ntTSL 520.77■□□□□ 0.926e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 420.37■□□□□ 0.856e-6■□□□□ 8.6
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ILF3Q12906 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.826e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.86e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-236ENST00000610014 475 ntTSL 519.97■□□□□ 0.796e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.796e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-204ENST00000540721 1308 ntTSL 219.27■□□□□ 0.686e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.616e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.596e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 218.66■□□□□ 0.586e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.546e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.56e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ABCD3-204ENST00000468860 661 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-9■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.446e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.446e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 DYNLL1-206ENST00000549649 794 ntTSL 317.79■□□□□ 0.446e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-206ENST00000563980 546 ntTSL 417.74■□□□□ 0.436e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-212ENST00000565062 1394 ntTSL 217.57■□□□□ 0.46e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GLDC-210ENST00000639020 401 ntTSL 317.56■□□□□ 0.46e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-217ENST00000568705 659 ntTSL 317.39■□□□□ 0.376e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 FKBP3-204ENST00000557324 643 ntTSL 517.28■□□□□ 0.366e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-205ENST00000594135 654 ntTSL 517.11■□□□□ 0.336e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-235ENST00000609914 644 ntTSL 517.11■□□□□ 0.336e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-203ENST00000439080 1388 ntTSL 216.71■□□□□ 0.276e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-225ENST00000621715 816 ntTSL 316.69■□□□□ 0.266e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GLDC-217ENST00000639840 600 ntTSL 516.6■□□□□ 0.256e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-213ENST00000565957 549 ntTSL 416.51■□□□□ 0.236e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.166e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-217ENST00000598150 751 ntTSL 515.99■□□□□ 0.156e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-209ENST00000596111 505 ntTSL 515.38■□□□□ 0.056e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 GAS8-203ENST00000537797 1080 ntTSL 215.3■□□□□ 0.046e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 ZSWIM5-202ENST00000464588 390 ntTSL 315.26■□□□□ 0.036e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 SLC25A10-204ENST00000570310 595 ntTSL 315.09■□□□□ 0.016e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.046e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-231ENST00000639599 1283 ntTSL 514.74□□□□□ -0.056e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.16e-6■□□□□ 8.6
ILF3Q12906 TARDBP-204ENST00000472476 1001 ntTSL 514.31□□□□□ -0.126e-6■□□□□ 8.6
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