Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SSBP3-201ENST00000326956 2913 ntTSL 213.44□□□□□ -0.261e-8■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.16e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.136e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.483e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.653e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.63e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 218.17■□□□□ 0.53e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 218.01■□□□□ 0.473e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.093e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 525.19■■□□□ 1.621e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SDCCAG3-209ENST00000468963 686 ntTSL 214.74□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SDCCAG3-211ENST00000486441 570 ntTSL 514.23□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 ROR2-205ENST00000495386 664 ntTSL 313.86□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 ROR2-206ENST00000546883 501 ntTSL 312.97□□□□□ -0.332e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 SDCCAG3-205ENST00000417512 626 ntTSL 212.5□□□□□ -0.411e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 DLG5-207ENST00000475613 7246 ntTSL 512.18□□□□□ -0.461e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 DLG5-206ENST00000468332 5505 ntTSL 212.15□□□□□ -0.461e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 AACS-210ENST00000539251 555 ntTSL 411.43□□□□□ -0.581e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 AACS-205ENST00000441247 2536 ntTSL 510.88□□□□□ -0.671e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 ROR2-201ENST00000375708 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 AACS-202ENST00000316543 3115 ntTSL 29.85□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 RNF115-201ENST00000539368 3097 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 420.02■□□□□ 0.81e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 319.16■□□□□ 0.661e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 517.91■□□□□ 0.461e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 516.67■□□□□ 0.261e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-212ENST00000472878 556 ntTSL 516.57■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 216.26■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.091e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 515.47■□□□□ 0.071e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-209ENST00000461687 555 ntTSL 415.22■□□□□ 0.031e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-215ENST00000489427 564 ntTSL 413.81□□□□□ -0.21e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-217ENST00000491365 491 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)11.07□□□□□ -0.641e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-203ENST00000419837 538 ntTSL 411.03□□□□□ -0.641e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.661e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.711e-7■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 TRIP12-202ENST00000343290 583 ntTSL 318.55■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 TRIP12-208ENST00000430954 719 ntTSL 212.37□□□□□ -0.433e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 TRIP12-209ENST00000435716 603 ntTSL 38.15□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 TRIP12-207ENST00000428959 584 ntTSL 38.08□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 9.2
ILF3Q12906 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CD99-208ENST00000482405 842 ntTSL 220.69■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CD99-211ENST00000623253 573 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 ABCC6-203ENST00000574094 2260 ntTSL 513.2□□□□□ -0.34e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.284e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.144e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 PAPD5-204ENST00000562717 1866 ntTSL 514.3□□□□□ -0.124e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HELLS-207ENST00000419900 711 ntTSL 315.81■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 PABPC1L-205ENST00000372819 2100 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-8■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 STK38-201ENST00000229812 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 SLC23A2-203ENST00000423430 911 ntTSL 59.9□□□□□ -0.824e-8■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 AL139287.1-201ENST00000444968 386 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 PABPC1L-203ENST00000217075 670 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 PABPC1L-212ENST00000479873 1178 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.074e-8■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.114e-8■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 DLEU1-211ENST00000469127 320 ntTSL 57.65□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 WAPL-203ENST00000372075 1799 ntTSL 27.18□□□□□ -1.262e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-209ENST00000564678 2199 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-214ENST00000568651 458 ntTSL 35.74□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 DLEU1-205ENST00000463357 274 ntTSL 1 (best)5.66□□□□□ -1.52e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-208ENST00000563911 844 ntTSL 35.48□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 DLEU1-230ENST00000489542 780 ntTSL 1 (best)5.33□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.582e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-207ENST00000563781 774 ntTSL 35.06□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HERPUD1-213ENST00000568358 751 ntTSL 54.66□□□□□ -1.662e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 HELLS-208ENST00000462057 778 ntTSL 33.52□□□□□ -1.852e-6■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 EML4-205ENST00000409040 962 ntTSL 1 (best)16.97■□□□□ 0.311e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.284e-8■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.394e-8■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.64e-8■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 FANCD2-204ENST00000421731 3425 ntTSL 1 (best)3.9□□□□□ -1.784e-8■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.554e-9■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.613e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.573e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.553e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 GATD1-213ENST00000532320 1273 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.113e-7■□□□□ 9.1
ILF3Q12906 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.018e-9■□□□□ 9
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