Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP4B1Q9Y6B7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP4B1Q9Y6B7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP4B1Q9Y6B7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms