Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21AQ96BD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF21AQ96BD5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF21AQ96BD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms