Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 IVY1YDR229W 1362 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 CSM2YIL132C 642 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 PFK2YMR205C 2880 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 LSG1YGL099W 1923 nt6.74□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 OPI7YDR360W 435 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 YPT1YFL038C 621 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 YIL077CYIL077C 963 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 LIA1YJR070C 978 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 YNL165WYNL165W 1221 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 SAC6YDR129C 1929 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 FET4YMR319C 1659 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 QNS1YHR074W 2145 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 YML133CYML133C 4125 nt6.73□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 YCR049CYCR049C 447 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 URH1YDR400W 1023 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 PET117YER058W 324 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 YNL017CYNL017C 339 nt6.72□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 CIT2YCR005C 1383 nt6.71□□□□□ -1.33
SEC39Q12745 GPD1YDL022W 1176 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 DMC1YER179W 1005 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 HOC1YJR075W 1191 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 PSR2YLR019W 1194 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 YNL092WYNL092W 1203 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 IRC11YOR013W 471 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 MPA43YNL249C 1629 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 PAT1YCR077C 2391 nt6.71□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 CCW12YLR110C 402 nt6.7□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 SKN1YGR143W 2316 nt6.7□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 GDA1YEL042W 1557 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 PRY3YJL078C 2646 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 YEL020CYEL020C 1683 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 YJL163CYJL163C 1668 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 VPS61YDR136C 573 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 PDA1YER178W 1263 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 AIM3YBR108W 2844 nt6.69□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 CLB2YPR119W 1476 nt6.68□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 RRP46YGR095C 672 nt6.68□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 FBA1YKL060C 1080 nt6.68□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 MPE1YKL059C 1326 nt6.68□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 POX1YGL205W 2247 nt6.68□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 VPS5YOR069W 2028 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 GET4YOR164C 939 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 YPR076WYPR076W 375 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 MCM6YGL201C 3054 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 PTK2YJR059W 2457 nt6.67□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 YDL177CYDL177C 513 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 ARA2YMR041C 1008 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 YOL046CYOL046C 675 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 DPM1YPR183W 804 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 AMA1YGR225W 1782 nt6.66□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 AGX1YFL030W 1158 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 CBR1YIL043C 855 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 SCS22YBL091C-A 528 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 YCL049CYCL049C 939 nt6.65□□□□□ -1.34
SEC39Q12745 GYP8YFL027C 1494 nt6.65□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 MKK1YOR231W 1527 nt6.65□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 CDC16YKL022C 2523 nt6.65□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 SNU71YGR013W 1863 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 FIT2YOR382W 462 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YFR006WYFR006W 1608 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 NSE5YML023C 1671 nt6.64□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 CIA1YDR267C 993 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YFL042CYFL042C 2025 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YGR139WYGR139W 339 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 RPP1YHR062C 882 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 RTC4YNL254C 1206 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 ATF1YOR377W 1578 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YPR130CYPR130C 408 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YBR113WYBR113W 483 nt6.63□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 PPH21YDL134C 1110 nt6.62□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 MRPL35YDR322W 1104 nt6.62□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 HTZ1YOL012C 405 nt6.62□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 ALD6YPL061W 1503 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 CCC2YDR270W 3015 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 THI2YBR240C 1353 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 MRPL1YDR116C 858 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YKL153WYKL153W 510 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 REC114YMR133W 1287 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 YMR279CYMR279C 1623 nt6.61□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 SPS22YCL048W 1392 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 IMG1YCR046C 510 nt6.6□□□□□ -1.35
SEC39Q12745 SQT1YIR012W 1296 nt6.6□□□□□ -1.35
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