Protein–RNA interactions for Protein: Q12472

TY2B-DR1, Transposon Ty2-DR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-DR1Q12472 IRC11YOR013W 471 nt9.78□□□□□ -0.84
TY2B-DR1Q12472 ADE17YMR120C 1779 nt9.78□□□□□ -0.84
TY2B-DR1Q12472 SFP1YLR403W 2052 nt9.77□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 MRPS5YBR251W 924 nt9.77□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 FRE5YOR384W 2085 nt9.77□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 YTP1YNL237W 1380 nt9.76□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 RDN5-2RDN5-2 119 nt9.76□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 RDN5-3RDN5-3 119 nt9.76□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 RDN5-4RDN5-4 119 nt9.76□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 RDN5-5RDN5-5 119 nt9.76□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 CIN4YMR138W 576 nt9.75□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 SSO1YPL232W 873 nt9.75□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 HEM1YDR232W 1647 nt9.74□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 SNF4YGL115W 969 nt9.74□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 QCR6YFR033C 444 nt9.73□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 SEC13YLR208W 894 nt9.73□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 YLR312CYLR312C 1197 nt9.73□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt9.73□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 PKC1YBL105C 3456 nt9.73□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 MET30YIL046W 1923 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 MSY1YPL097W 1479 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 PYK2YOR347C 1521 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 PHB1YGR132C 864 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 DAL3YIR032C 588 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 AAD15YOL165C 432 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 ECM31YBR176W 939 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 MEX67YPL169C 1800 nt9.72□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 RIX7YLL034C 2514 nt9.71□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 MTR3YGR158C 753 nt9.71□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 EFM4YIL064W 774 nt9.71□□□□□ -0.85
TY2B-DR1Q12472 YEL023CYEL023C 2049 nt9.71□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 TPO3YPR156C 1869 nt9.71□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YPL264CYPL264C 1062 nt9.7□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 ATG12YBR217W 561 nt9.7□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 GNP1YDR508C 1992 nt9.7□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 PXL1YKR090W 2121 nt9.69□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YDL129WYDL129W 876 nt9.69□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 DYS1YHR068W 1164 nt9.69□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YLR112WYLR112W 420 nt9.69□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 PNP1YLR209C 936 nt9.69□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 LST8YNL006W 912 nt9.69□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 HXT9YJL219W 1704 nt9.68□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 UGX2YDL169C 672 nt9.68□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 MRPL22YNL177C 930 nt9.68□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 MRK1YDL079C 1506 nt9.67□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 COR1YBL045C 1374 nt9.67□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 AFG1YEL052W 1530 nt9.67□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YDL057WYDL057W 987 nt9.67□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt9.67□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YGR022CYGR022C 330 nt9.67□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YCR041WYCR041W 333 nt9.66□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 LOT6YLR011W 576 nt9.66□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YNL120CYNL120C 486 nt9.66□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 NUP84YDL116W 2181 nt9.66□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 MEH1YKR007W 555 nt9.65□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 PUF3YLL013C 2640 nt9.65□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 TOK1YJL093C 2076 nt9.65□□□□□ -0.86
TY2B-DR1Q12472 YLR194CYLR194C 765 nt9.65□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 SNO4YMR322C 714 nt9.64□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 HSP33YOR391C 714 nt9.64□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 HSP32YPL280W 714 nt9.64□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 MHP1YJL042W 4197 nt9.64□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 ERS1YCR075C 783 nt9.63□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 RRS1YOR294W 612 nt9.63□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 YGL036WYGL036W 2730 nt9.63□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 CCT3YJL014W 1605 nt9.63□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 RGD2YFL047W 2145 nt9.63□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 YLR283WYLR283W 945 nt9.63□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 ALD5YER073W 1563 nt9.62□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 TEA1YOR337W 2280 nt9.61□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 TOD6YBL054W 1578 nt9.6□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 GEF1YJR040W 2340 nt9.6□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 EXG1YLR300W 1347 nt9.59□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 DCN1YLR128W 810 nt9.59□□□□□ -0.87
TY2B-DR1Q12472 ASK1YKL052C 879 nt9.58□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 HBN1YCL026C-B 582 nt9.58□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 YCK1YHR135C 1617 nt9.58□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 AIM2YAL049C 741 nt9.58□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 RKI1YOR095C 777 nt9.58□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt9.57□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 YJL045WYJL045W 1905 nt9.57□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 YOR012WYOR012W 414 nt9.55□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 SEC24YIL109C 2781 nt9.55□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt9.55□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 SYN8YAL014C 768 nt9.55□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 FBA1YKL060C 1080 nt9.55□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 DAP1YPL170W 459 nt9.55□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 SQT1YIR012W 1296 nt9.54□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 GPB2YAL056W 2643 nt9.54□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 PEX31YGR004W 1389 nt9.54□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 IME2YJL106W 1938 nt9.53□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 RRP45YDR280W 918 nt9.52□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 YPT1YFL038C 621 nt9.52□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 HXK1YFR053C 1458 nt9.52□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 VMA16YHR026W 642 nt9.52□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 BRL1YHR036W 1416 nt9.52□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 MDM31YHR194W 1740 nt9.52□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 MIA40YKL195W 1212 nt9.52□□□□□ -0.88
TY2B-DR1Q12472 NPP1YCR026C 2229 nt9.52□□□□□ -0.89
TY2B-DR1Q12472 MIP1YOR330C 3765 nt9.52□□□□□ -0.89
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