Protein–RNA interactions for Protein: P47821

SSN8, RNA polymerase II holoenzyme cyclin-like subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSN8P47821 RPL5YPL131W 894 nt5.93□□□□□ -1.46
SSN8P47821 NAF1YNL124W 1479 nt5.93□□□□□ -1.46
SSN8P47821 GDA1YEL042W 1557 nt5.93□□□□□ -1.46
SSN8P47821 YIR007WYIR007W 2295 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 YDR514CYDR514C 1452 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 AI5_BETAQ0075 1065 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 RRP46YGR095C 672 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 DUS4YLR405W 1104 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 MCM6YGL201C 3054 nt5.92□□□□□ -1.46
SSN8P47821 POX1YGL205W 2247 nt5.91□□□□□ -1.46
SSN8P47821 CST6YIL036W 1764 nt5.91□□□□□ -1.46
SSN8P47821 CIA1YDR267C 993 nt5.91□□□□□ -1.46
SSN8P47821 PDA1YER178W 1263 nt5.91□□□□□ -1.46
SSN8P47821 ICS3YJL077C 396 nt5.91□□□□□ -1.46
SSN8P47821 CYS3YAL012W 1185 nt5.91□□□□□ -1.46
SSN8P47821 HTZ1YOL012C 405 nt5.91□□□□□ -1.46
SSN8P47821 snR30snR30 606 nt5.91□□□□□ -1.46
SSN8P47821 SWP1YMR149W 861 nt5.9□□□□□ -1.46
SSN8P47821 PRE5YMR314W 705 nt5.9□□□□□ -1.46
SSN8P47821 MRPS12YNR036C 462 nt5.9□□□□□ -1.46
SSN8P47821 NTG2YOL043C 1143 nt5.9□□□□□ -1.46
SSN8P47821 VBA1YMR088C 1689 nt5.89□□□□□ -1.47
SSN8P47821 YNR005CYNR005C 405 nt5.89□□□□□ -1.47
SSN8P47821 YOL099CYOL099C 492 nt5.89□□□□□ -1.47
SSN8P47821 YCL049CYCL049C 939 nt5.89□□□□□ -1.47
SSN8P47821 IVY1YDR229W 1362 nt5.89□□□□□ -1.47
SSN8P47821 RGD2YFL047W 2145 nt5.89□□□□□ -1.47
SSN8P47821 YML133CYML133C 4125 nt5.89□□□□□ -1.47
SSN8P47821 BUD9YGR041W 1644 nt5.88□□□□□ -1.47
SSN8P47821 MIP1YOR330C 3765 nt5.88□□□□□ -1.47
SSN8P47821 COX9YDL067C 180 nt5.88□□□□□ -1.47
SSN8P47821 TUF1YOR187W 1314 nt5.88□□□□□ -1.47
SSN8P47821 GPA2YER020W 1350 nt5.88□□□□□ -1.47
SSN8P47821 VPS70YJR126C 2436 nt5.88□□□□□ -1.47
SSN8P47821 RPR1RPR1 369 nt5.87□□□□□ -1.47
SSN8P47821 CPA1YOR303W 1236 nt5.87□□□□□ -1.47
SSN8P47821 APE4YHR113W 1473 nt5.87□□□□□ -1.47
SSN8P47821 PAC2YER007W 1557 nt5.87□□□□□ -1.47
SSN8P47821 IRS4YKR019C 1848 nt5.87□□□□□ -1.47
SSN8P47821 PTK2YJR059W 2457 nt5.87□□□□□ -1.47
SSN8P47821 MRC1YCL061C 3291 nt5.87□□□□□ -1.47
SSN8P47821 GUP2YPL189W 1830 nt5.86□□□□□ -1.47
SSN8P47821 AMA1YGR225W 1782 nt5.86□□□□□ -1.47
SSN8P47821 ASN1YPR145W 1719 nt5.86□□□□□ -1.47
SSN8P47821 YLR162WYLR162W 357 nt5.86□□□□□ -1.47
SSN8P47821 ERG7YHR072W 2196 nt5.86□□□□□ -1.47
SSN8P47821 DBP9YLR276C 1785 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 OXP1YKL215C 3861 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 PYK2YOR347C 1521 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 MKK2YPL140C 1521 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 PEX31YGR004W 1389 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 ROG3YFR022W 2202 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 PTC7YHR076W 1032 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 YJL144WYJL144W 315 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 REC107YJR021C 945 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 YOX1YML027W 1158 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 SPG5YMR191W 1122 nt5.85□□□□□ -1.47
SSN8P47821 HIS1YER055C 894 nt5.84□□□□□ -1.47
SSN8P47821 DYS1YHR068W 1164 nt5.84□□□□□ -1.47
SSN8P47821 RPS28AYOR167C 204 nt5.84□□□□□ -1.47
SSN8P47821 NSE5YML023C 1671 nt5.84□□□□□ -1.47
SSN8P47821 EIS1YMR031C 2532 nt5.84□□□□□ -1.47
SSN8P47821 YPL247CYPL247C 1572 nt5.84□□□□□ -1.48
SSN8P47821 PPM2YOL141W 2088 nt5.83□□□□□ -1.48
SSN8P47821 TRS31YDR472W 852 nt5.83□□□□□ -1.48
SSN8P47821 ARO7YPR060C 771 nt5.83□□□□□ -1.48
SSN8P47821 AIM46YHR199C 933 nt5.82□□□□□ -1.48
SSN8P47821 VPS1YKR001C 2115 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 SPS22YCL048W 1392 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YMR034CYMR034C 1305 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 PAP2YOL115W 1755 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 NPA3YJR072C 1158 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 GCN3YKR026C 918 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 RPL31BYLR406C 342 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 CUE4YML101C 354 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 CHS5YLR330W 2016 nt5.81□□□□□ -1.48
SSN8P47821 MAL11YGR289C 1851 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YJL163CYJL163C 1668 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 MRPS28YDR337W 861 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YGL102CYGL102C 429 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YJL171CYJL171C 1191 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 SML1YML058W 315 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 COX5AYNL052W 462 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 ECM3YOR092W 1842 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 SET5YHR207C 1581 nt5.8□□□□□ -1.48
SSN8P47821 CLB2YPR119W 1476 nt5.79□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YDL177CYDL177C 513 nt5.79□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.79□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YSC83YHR017W 1158 nt5.79□□□□□ -1.48
SSN8P47821 YKR032WYKR032W 315 nt5.79□□□□□ -1.48
SSN8P47821 FIT2YOR382W 462 nt5.79□□□□□ -1.48
SSN8P47821 ERG10YPL028W 1197 nt5.79□□□□□ -1.48
SSN8P47821 SMX3YPR182W 261 nt5.79□□□□□ -1.48
SSN8P47821 MFG1YDL233W 1377 nt5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.6 ms