Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 MAK31YCR020C-A 267 nt8.76□□□□□ -1.01
PDR11P40550 GON7YJL184W 372 nt8.76□□□□□ -1.01
PDR11P40550 AIM2YAL049C 741 nt8.76□□□□□ -1.01
PDR11P40550 KSH1YNL024C-A 219 nt8.76□□□□□ -1.01
PDR11P40550 YET3YDL072C 612 nt8.75□□□□□ -1.01
PDR11P40550 snR82snR82 268 nt8.75□□□□□ -1.01
PDR11P40550 JNM1YMR294W 1122 nt8.75□□□□□ -1.01
PDR11P40550 SHP1YBL058W 1272 nt8.75□□□□□ -1.01
PDR11P40550 YIL177CYIL177C 5277 nt8.74□□□□□ -1.01
PDR11P40550 TIM22YDL217C 624 nt8.74□□□□□ -1.01
PDR11P40550 YJR084WYJR084W 1272 nt8.74□□□□□ -1.01
PDR11P40550 RPS5YJR123W 678 nt8.74□□□□□ -1.01
PDR11P40550 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt8.74□□□□□ -1.01
PDR11P40550 HRQ1YDR291W 3234 nt8.74□□□□□ -1.01
PDR11P40550 MSY1YPL097W 1479 nt8.74□□□□□ -1.01
PDR11P40550 MRPS12YNR036C 462 nt8.73□□□□□ -1.01
PDR11P40550 LDB16YCL005W 771 nt8.73□□□□□ -1.01
PDR11P40550 HBN1YCL026C-B 582 nt8.73□□□□□ -1.01
PDR11P40550 CRF1YDR223W 1404 nt8.73□□□□□ -1.01
PDR11P40550 DFM1YDR411C 1026 nt8.72□□□□□ -1.01
PDR11P40550 SLA2YNL243W 2907 nt8.72□□□□□ -1.01
PDR11P40550 BUG1YDL099W 1026 nt8.71□□□□□ -1.01
PDR11P40550 SKG1YKR100C 1068 nt8.71□□□□□ -1.02
PDR11P40550 RPS3YNL178W 723 nt8.71□□□□□ -1.02
PDR11P40550 TOS6YNL300W 309 nt8.71□□□□□ -1.02
PDR11P40550 ILV1YER086W 1731 nt8.7□□□□□ -1.02
PDR11P40550 RSC30YHR056C 2652 nt8.69□□□□□ -1.02
PDR11P40550 YPT1YFL038C 621 nt8.69□□□□□ -1.02
PDR11P40550 MIA40YKL195W 1212 nt8.69□□□□□ -1.02
PDR11P40550 YLR312CYLR312C 1197 nt8.69□□□□□ -1.02
PDR11P40550 MET30YIL046W 1923 nt8.69□□□□□ -1.02
PDR11P40550 SKS1YPL026C 1509 nt8.68□□□□□ -1.02
PDR11P40550 SPT3YDR392W 1014 nt8.68□□□□□ -1.02
PDR11P40550 YJR154WYJR154W 1041 nt8.68□□□□□ -1.02
PDR11P40550 FBA1YKL060C 1080 nt8.68□□□□□ -1.02
PDR11P40550 ARC35YNR035C 1029 nt8.68□□□□□ -1.02
PDR11P40550 ECM31YBR176W 939 nt8.68□□□□□ -1.02
PDR11P40550 CAF40YNL288W 1122 nt8.67□□□□□ -1.02
PDR11P40550 RPP1YHR062C 882 nt8.66□□□□□ -1.02
PDR11P40550 SQT1YIR012W 1296 nt8.66□□□□□ -1.02
PDR11P40550 YNR014WYNR014W 639 nt8.66□□□□□ -1.02
PDR11P40550 ICL1YER065C 1674 nt8.66□□□□□ -1.02
PDR11P40550 MTC2YKL098W 1074 nt8.65□□□□□ -1.02
PDR11P40550 RPL10YLR075W 666 nt8.65□□□□□ -1.02
PDR11P40550 YNL190WYNL190W 615 nt8.65□□□□□ -1.02
PDR11P40550 ADE17YMR120C 1779 nt8.65□□□□□ -1.02
PDR11P40550 BNA3YJL060W 1335 nt8.64□□□□□ -1.03
PDR11P40550 YDR415CYDR415C 1125 nt8.64□□□□□ -1.03
PDR11P40550 PRS2YER099C 957 nt8.64□□□□□ -1.03
PDR11P40550 TMT1YER175C 900 nt8.64□□□□□ -1.03
PDR11P40550 YJR107WYJR107W 987 nt8.64□□□□□ -1.03
PDR11P40550 MEH1YKR007W 555 nt8.63□□□□□ -1.03
PDR11P40550 GPH1YPR160W 2709 nt8.63□□□□□ -1.03
PDR11P40550 GSH1YJL101C 2037 nt8.63□□□□□ -1.03
PDR11P40550 YTP1YNL237W 1380 nt8.63□□□□□ -1.03
PDR11P40550 POB3YML069W 1659 nt8.62□□□□□ -1.03
PDR11P40550 RIX7YLL034C 2514 nt8.62□□□□□ -1.03
PDR11P40550 MCH2YKL221W 1422 nt8.61□□□□□ -1.03
PDR11P40550 FRE5YOR384W 2085 nt8.61□□□□□ -1.03
PDR11P40550 RPN11YFR004W 921 nt8.61□□□□□ -1.03
PDR11P40550 RFS1YBR052C 633 nt8.61□□□□□ -1.03
PDR11P40550 HST3YOR025W 1344 nt8.6□□□□□ -1.03
PDR11P40550 TAH11YJR046W 1815 nt8.59□□□□□ -1.03
PDR11P40550 LAS17YOR181W 1902 nt8.59□□□□□ -1.03
PDR11P40550 ADE12YNL220W 1302 nt8.59□□□□□ -1.03
PDR11P40550 SPO7YAL009W 780 nt8.59□□□□□ -1.03
PDR11P40550 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt8.59□□□□□ -1.03
PDR11P40550 GCN3YKR026C 918 nt8.58□□□□□ -1.04
PDR11P40550 YML012C-AYML012C-A 378 nt8.58□□□□□ -1.04
PDR11P40550 CIN4YMR138W 576 nt8.58□□□□□ -1.04
PDR11P40550 RPL5YPL131W 894 nt8.58□□□□□ -1.04
PDR11P40550 CYB2YML054C 1776 nt8.58□□□□□ -1.04
PDR11P40550 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt8.57□□□□□ -1.04
PDR11P40550 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt8.57□□□□□ -1.04
PDR11P40550 COX16YJL003W 357 nt8.57□□□□□ -1.04
PDR11P40550 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt8.57□□□□□ -1.04
PDR11P40550 PHB1YGR132C 864 nt8.56□□□□□ -1.04
PDR11P40550 AQR1YNL065W 1761 nt8.56□□□□□ -1.04
PDR11P40550 COX20YDR231C 618 nt8.55□□□□□ -1.04
PDR11P40550 YLR123CYLR123C 330 nt8.55□□□□□ -1.04
PDR11P40550 MCH1YDL054C 1461 nt8.55□□□□□ -1.04
PDR11P40550 THI2YBR240C 1353 nt8.55□□□□□ -1.04
PDR11P40550 ISN1YOR155C 1353 nt8.54□□□□□ -1.04
PDR11P40550 PAC10YGR078C 600 nt8.54□□□□□ -1.04
PDR11P40550 RRS1YOR294W 612 nt8.54□□□□□ -1.04
PDR11P40550 CDC34YDR054C 888 nt8.53□□□□□ -1.04
PDR11P40550 NTG1YAL015C 1200 nt8.53□□□□□ -1.04
PDR11P40550 SSP120YLR250W 705 nt8.53□□□□□ -1.04
PDR11P40550 HHY1YEL059W 309 nt8.52□□□□□ -1.05
PDR11P40550 YIR042CYIR042C 711 nt8.52□□□□□ -1.05
PDR11P40550 AIM24YJR080C 1185 nt8.52□□□□□ -1.05
PDR11P40550 COR1YBL045C 1374 nt8.51□□□□□ -1.05
PDR11P40550 UTR2YEL040W 1404 nt8.51□□□□□ -1.05
PDR11P40550 GAT4YIR013C 366 nt8.5□□□□□ -1.05
PDR11P40550 LCB3YJL134W 1230 nt8.5□□□□□ -1.05
PDR11P40550 YLL066CYLL066C 3618 nt8.49□□□□□ -1.05
PDR11P40550 UGX2YDL169C 672 nt8.49□□□□□ -1.05
PDR11P40550 PYK2YOR347C 1521 nt8.49□□□□□ -1.05
PDR11P40550 TPO3YPR156C 1869 nt8.49□□□□□ -1.05
PDR11P40550 MDM31YHR194W 1740 nt8.48□□□□□ -1.05
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