Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms