Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1BQ86YN6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1BQ86YN6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms