Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEC24CP53992 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEC24CP53992 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms