Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 SAFB-214ENST00000592707 940 ntTSL 215.37■□□□□ 0.056e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.66e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 CEP57-202ENST00000325542 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.636e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.076e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 SAFB-212ENST00000592396 620 ntTSL 46.76□□□□□ -1.336e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 CEP57-203ENST00000535224 760 ntTSL 36.16□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 CEP57-206ENST00000537093 404 ntTSL 54.54□□□□□ -1.686e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -26e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.079e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.039e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 MAN2A1-202ENST00000502261 448 ntTSL 53.94□□□□□ -1.789e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.772e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 DLC1-205ENST00000506171 560 ntTSL 45.68□□□□□ -1.51e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 225.37■■□□□ 1.654e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 510.24□□□□□ -0.774e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.698e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.648e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.438e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.48e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.79■□□□□ 0.128e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.88e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -18e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 STAT5B-203ENST00000468312 1799 ntTSL 1 (best)26.56■■□□□ 1.843e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 STAT5B-202ENST00000415845 559 ntTSL 48.07□□□□□ -1.123e-6■□□□□ 10.3
SAFBQ15424 ANKRD12-202ENST00000359158 2250 ntTSL 22.94□□□□□ -1.949e-6■□□□□ 10.2
SAFBQ15424 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.422e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SLC22A23-212ENST00000497691 2555 ntTSL 1 (best)17.58■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SLC22A23-207ENST00000467177 1221 ntTSL 1 (best)15.99■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SLC22A23-209ENST00000485307 1574 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SLC22A23-206ENST00000467144 542 ntTSL 415.05■□□□□ -02e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 413.04□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.462e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.862e-7■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 223.8■■□□□ 1.42e-7■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-7■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.932e-7■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 316.27■□□□□ 0.25e-9■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 513.3□□□□□ -0.285e-9■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 513.27□□□□□ -0.295e-9■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 313.26□□□□□ -0.295e-9■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 213.22□□□□□ -0.295e-9■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 211.65□□□□□ -0.545e-9■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.575e-9■□□□□ 10.1
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SAFBQ15424 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.875e-9■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.965e-9■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 LYPLAL1-203ENST00000460522 1703 ntTSL 221.12■□□□□ 0.972e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 LYPLAL1-208ENST00000477938 1715 ntTSL 220.36■□□□□ 0.852e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 LYPLAL1-211ENST00000483635 2169 ntTSL 317.28■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 LYPLAL1-204ENST00000463964 1874 ntTSL 39.57□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 LYPLAL1-206ENST00000474379 1662 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -12e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 LYPLAL1-207ENST00000475724 1715 ntTSL 35.51□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 10.1
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SAFBQ15424 DLC1-204ENST00000503161 562 ntTSL 411.34□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.712e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 TPTEP1-201ENST00000383140 971 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 10.1
SAFBQ15424 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.354e-6■□□□□ 10
SAFBQ15424 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.574e-6■□□□□ 10
SAFBQ15424 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.124e-6■□□□□ 10
SAFBQ15424 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.564e-6■□□□□ 10
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SAFBQ15424 TP73-AS1-209ENST00000636630 2529 ntTSL 517.49■□□□□ 0.391e-9■□□□□ 10
SAFBQ15424 TP73-AS1-201ENST00000418088 3329 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.181e-9■□□□□ 10
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SAFBQ15424 TP73-AS1-206ENST00000608600 597 ntTSL 512.48□□□□□ -0.411e-9■□□□□ 10
SAFBQ15424 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.515e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 310.78□□□□□ -0.685e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 410.54□□□□□ -0.725e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 56.54□□□□□ -1.365e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.622e-6■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 511.41□□□□□ -0.583e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.83e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.953e-7■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.943e-6■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 9.9
SAFBQ15424 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.692e-6■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.642e-6■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 412.21□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-7■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 323.27■■□□□ 1.324e-9■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 421.43■■□□□ 1.024e-9■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.874e-9■□□□□ 9.8
SAFBQ15424 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 418.74■□□□□ 0.594e-9■□□□□ 9.8
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