Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 ECM10YEL030W 1935 nt6.95□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 CUP2YGL166W 678 nt6.95□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 YSC83YHR017W 1158 nt6.95□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 YML018CYML018C 1182 nt6.95□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 AMN1YBR158W 1650 nt6.94□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 NUP84YDL116W 2181 nt6.94□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 MRPL28YDR462W 444 nt6.94□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 YLR112WYLR112W 420 nt6.94□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 AVO2YMR068W 1281 nt6.94□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 UIP5YKR044W 1332 nt6.94□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 PPM2YOL141W 2088 nt6.94□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 YDR387CYDR387C 1668 nt6.93□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 AQR1YNL065W 1761 nt6.93□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 PAC2YER007W 1557 nt6.93□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 VMA3YEL027W 483 nt6.92□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 CCT8YJL008C 1707 nt6.92□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 COX10YPL172C 1389 nt6.92□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 FSF1YOR271C 984 nt6.91□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 POB3YML069W 1659 nt6.9□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 MSP1YGR028W 1089 nt6.9□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 FAF1YIL019W 1041 nt6.9□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 RNH201YNL072W 924 nt6.9□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 ATO2YNR002C 849 nt6.9□□□□□ -1.3
CTF3Q12748 ZWF1YNL241C 1518 nt6.9□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 YER137CYER137C 447 nt6.89□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 ATG36YJL185C 882 nt6.89□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 YMR295CYMR295C 594 nt6.89□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 CTF19YPL018W 1110 nt6.89□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 MTR3YGR158C 753 nt6.88□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 MPC2YHR162W 390 nt6.88□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 AIM2YAL049C 741 nt6.88□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 YOR012WYOR012W 414 nt6.87□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 STT3YGL022W 2157 nt6.86□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 PPH22YDL188C 1134 nt6.86□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 COG1YGL223C 1254 nt6.86□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 RFC4YOL094C 972 nt6.86□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 IRC11YOR013W 471 nt6.86□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 NDE1YMR145C 1683 nt6.86□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 YMR279CYMR279C 1623 nt6.86□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 AFG2YLR397C 2343 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 CIT3YPR001W 1461 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 DID2YKR035W-A 615 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 QRI5YLR204W 336 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 RGD2YFL047W 2145 nt6.85□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 ERS1YCR075C 783 nt6.84□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 SCS7YMR272C 1155 nt6.84□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 MRPL10YNL284C 969 nt6.84□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 MSO1YNR049C 633 nt6.84□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 SGF29YCL010C 780 nt6.84□□□□□ -1.31
CTF3Q12748 LYS1YIR034C 1122 nt6.83□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YJR146WYJR146W 354 nt6.83□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YIL108WYIL108W 2091 nt6.83□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 MAK32YCR019W 1092 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 FAL1YDR021W 1200 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 MCH2YKL221W 1422 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 PTC3YBL056W 1407 nt6.82□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 EHD3YDR036C 1503 nt6.81□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 RUF23RUF23 254 nt6.81□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 ARC35YNR035C 1029 nt6.81□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YPL257WYPL257W 582 nt6.81□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YPR196WYPR196W 1413 nt6.81□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 KDX1YKL161C 1302 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YPL277CYPL277C 1464 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YBR241CYBR241C 1467 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 ARE2YNR019W 1929 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 MED6YHR058C 888 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 RMA1YKL132C 1293 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 SRL2YLR082C 1179 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 OGG1YML060W 1131 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 HBN1YCL026C-B 582 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 SMC5YOL034W 3282 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YNL040WYNL040W 1371 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 SLA2YNL243W 2907 nt6.8□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 GFA1YKL104C 2154 nt6.79□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 BNA3YJL060W 1335 nt6.79□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 CIR2YOR356W 1896 nt6.79□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 SHO1YER118C 1104 nt6.79□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 DSF1YEL070W 1509 nt6.79□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YNR073CYNR073C 1509 nt6.79□□□□□ -1.32
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