Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 FSF1YOR271C 984 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 RXT2YBR095C 1293 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 PMA2YPL036W 2844 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 AAD6YFL056C 639 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ADE1YAR015W 921 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YMR178WYMR178W 825 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ROT1YMR200W 771 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 AAH1YNL141W 1044 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 NTG2YOL043C 1143 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 BUD21YOR078W 645 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ELC1YPL046C 300 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ECM8YBR076W 1065 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 MMR1YLR190W 1476 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YLR072WYLR072W 2082 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 HEM14YER014W 1620 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 SPO11YHL022C 1197 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 FYV6YNL133C 522 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 GPN2YOR262W 1044 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 JID1YPR061C 906 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YLR108CYLR108C 1458 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YDR467CYDR467C 327 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 STE2YFL026W 1296 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ELF1YKL160W 438 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 DID2YKR035W-A 615 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 AIM34YMR003W 597 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YBL036CYBL036C 774 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ARG8YOL140W 1272 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 FIT3YOR383C 615 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 CIT3YPR001W 1461 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YLR345WYLR345W 1530 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 KCH1YJR054W 1494 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 HSV2YGR223C 1347 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 RRT5YFR032C 870 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 COG2YGR120C 789 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 LOT5YKL183W 921 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YKL202WYKL202W 582 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 EMC3YKL207W 762 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 HAL1YPR005C 885 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 HEM3YDL205C 984 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 ERG26YGL001C 1050 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 PAN5YHR063C 1140 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YJL032WYJL032W 315 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 EFM3YJR129C 1020 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 DRE2YKR071C 1047 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 BSC4YNL269W 396 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 RFM1YOR279C 933 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 SMA1YPL027W 738 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 LEU2YCL018W 1095 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 KAR5YMR065W 1515 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 GND1YHR183W 1470 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 NSA1YGL111W 1392 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 RRG1YDR065W 1098 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 NCS6YGL211W 1080 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 IMP3YHR148W 552 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YHC3YJL059W 1227 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 CPR7YJR032W 1182 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 NCE103YNL036W 666 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 SUI3YPL237W 858 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 UBP8YMR223W 1416 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 HSE1YHL002W 1359 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 HXT12YIL170W 1374 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 CDC16YKL022C 2523 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 CNM67YNL225C 1746 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YJR124CYJR124C 1347 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 RAV2YDR202C 1056 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 NSE3YDR288W 912 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 DCV1YFR012W 609 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 CLC1YGR167W 702 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 RSM26YJR101W 801 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 PRE7YBL041W 726 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 IPP1YBR011C 864 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 UBA4YHR111W 1323 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 ABD1YBR236C 1311 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 CSM1YCR086W 573 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 HSP31YDR533C 714 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YLR194CYLR194C 765 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 NAT4YMR069W 858 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YBR013CYBR013C 390 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 ERG13YML126C 1476 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 TEC1YBR083W 1461 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 SGV1YPR161C 1974 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 OCH1YGL038C 1443 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 AAT1YKL106W 1356 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 SRG1SRG1 551 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YEL028WYEL028W 462 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YIL168WYIL168W 384 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 POL32YJR043C 1053 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 YLR379WYLR379W 375 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 REX4YOL080C 870 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 SMK1YPR054W 1167 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-DR3Q12441 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.2 ms