Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YOR012W	YOR012W	414 nt		7.62	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	YBR027C	YBR027C	333 nt		7.62	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	PAC2	YER007W	1557 nt		7.62	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	NMD5	YJR132W	3147 nt		7.62	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	COQ1	YBR003W	1422 nt		7.61	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	ADE17	YMR120C	1779 nt		7.61	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	YHR020W	YHR020W	2067 nt		7.61	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	ACO1	YLR304C	2337 nt		7.61	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	GPD2	YOL059W	1323 nt		7.6	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	YDR187C	YDR187C	519 nt		7.6	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	YMR122C	YMR122C	375 nt		7.6	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	ICL2	YPR006C	1728 nt		7.6	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	MRPL28	YDR462W	444 nt		7.59	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	CUP2	YGL166W	678 nt		7.59	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	YHR213W-B	YHR213W-B	300 nt		7.59	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	YAR064W	YAR064W	300 nt		7.59	□□□□□ -1.19
MRD1	Q06106	COX10	YPL172C	1389 nt		7.59	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	SRF1	YDL133W	1314 nt		7.58	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	PAC10	YGR078C	600 nt		7.58	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	PPM2	YOL141W	2088 nt		7.58	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	RRP9	YPR137W	1722 nt		7.58	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	CBK1	YNL161W	2271 nt		7.57	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	YEL075W-A	YEL075W-A	612 nt		7.57	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	YLR463C	YLR463C	552 nt		7.57	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	TAE1	YBR261C	699 nt		7.57	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	VTS1	YOR359W	1572 nt		7.57	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	ASN2	YGR124W	1719 nt		7.57	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	HHY1	YEL059W	309 nt		7.56	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	MTR3	YGR158C	753 nt		7.56	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	TDH2	YJR009C	999 nt		7.56	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	PPS1	YBR276C	2424 nt		7.56	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	YEN1	YER041W	2280 nt		7.55	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	UIP5	YKR044W	1332 nt		7.55	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	CTF19	YPL018W	1110 nt		7.55	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	AGP2	YBR132C	1791 nt		7.55	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	YOS9	YDR057W	1629 nt		7.55	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	UBP13	YBL067C	2244 nt		7.55	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	CCT8	YJL008C	1707 nt		7.55	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	YML018C	YML018C	1182 nt		7.54	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	VMA3	YEL027W	483 nt		7.53	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	MCH2	YKL221W	1422 nt		7.52	□□□□□ -1.2
MRD1	Q06106	TRR1	YDR353W	960 nt		7.52	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	RDN5-2	RDN5-2	119 nt		7.52	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	RDN5-3	RDN5-3	119 nt		7.52	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	RDN5-4	RDN5-4	119 nt		7.52	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	RDN5-5	RDN5-5	119 nt		7.52	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	RFC4	YOL094C	972 nt		7.52	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	ZWF1	YNL241C	1518 nt		7.52	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	SLA2	YNL243W	2907 nt		7.51	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	YFL013W-A	YFL013W-A	804 nt		7.51	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	MSP1	YGR028W	1089 nt		7.51	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	ATG36	YJL185C	882 nt		7.51	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	IRC11	YOR013W	471 nt		7.51	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	STT3	YGL022W	2157 nt		7.51	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	SGE1	YPR198W	1632 nt		7.51	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	MLS1	YNL117W	1665 nt		7.51	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	NTE1	YML059C	5040 nt		7.5	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	FAL1	YDR021W	1200 nt		7.5	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	SCS7	YMR272C	1155 nt		7.5	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	ARC35	YNR035C	1029 nt		7.5	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	SGF29	YCL010C	780 nt		7.5	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	HBN1	YCL026C-B	582 nt		7.5	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	YDR387C	YDR387C	1668 nt		7.5	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	RGD2	YFL047W	2145 nt		7.49	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	CIR2	YOR356W	1896 nt		7.49	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	DAL7	YIR031C	1665 nt		7.49	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	MSO1	YNR049C	633 nt		7.49	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	DFR1	YOR236W	636 nt		7.49	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	YPL257W	YPL257W	582 nt		7.49	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	KIN1	YDR122W	3195 nt		7.48	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	ERS1	YCR075C	783 nt		7.48	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	PPH22	YDL188C	1134 nt		7.48	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	LYS1	YIR034C	1122 nt		7.48	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	MGM101	YJR144W	810 nt		7.48	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	DID2	YKR035W-A	615 nt		7.48	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	MIP1	YOR330C	3765 nt		7.47	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	FSF1	YOR271C	984 nt		7.47	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	TAH11	YJR046W	1815 nt		7.47	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	CYB2	YML054C	1776 nt		7.46	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	CCT3	YJL014W	1605 nt		7.46	□□□□□ -1.21
MRD1	Q06106	tG(GCC)B	tG(GCC)B	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	SUF16	tG(GCC)C	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)D1	tG(GCC)D1	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)D2	tG(GCC)D2	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)E	tG(GCC)E	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	SUF20	tG(GCC)F1	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)F2	tG(GCC)F2	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)G1	tG(GCC)G1	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)G2	tG(GCC)G2	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)J1	tG(GCC)J1	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	SUF23	tG(GCC)J2	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)M	tG(GCC)M	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)O1	tG(GCC)O1	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	SUF17	tG(GCC)O2	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)P1	tG(GCC)P1	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	tG(GCC)P2	tG(GCC)P2	71 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	YJR146W	YJR146W	354 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	YMR295C	YMR295C	594 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	RNH201	YNL072W	924 nt		7.46	□□□□□ -1.22
MRD1	Q06106	YMR279C	YMR279C	1623 nt		7.45	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.3 ms